More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1976 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1976  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
152 aa  294  4e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2140  50S ribosomal protein L9  80.67 
 
 
150 aa  214  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  61.22 
 
 
150 aa  187  5e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  56.46 
 
 
151 aa  164  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  53.06 
 
 
154 aa  149  8.999999999999999e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1966  50S ribosomal protein L9  55.78 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0789  50S ribosomal protein L9  58 
 
 
150 aa  143  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  55.78 
 
 
149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  48.98 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  55.41 
 
 
149 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  51.7 
 
 
148 aa  123  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  50.68 
 
 
148 aa  117  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  51.7 
 
 
148 aa  117  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  51.7 
 
 
148 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  51.7 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  51.7 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  51.7 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  51.7 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  51.7 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  51.7 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  51.02 
 
 
148 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  52.38 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  39.6 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  42.18 
 
 
148 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  44 
 
 
148 aa  103  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
151 aa  103  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  41.5 
 
 
159 aa  103  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
151 aa  103  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  37.24 
 
 
149 aa  103  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  38.78 
 
 
151 aa  103  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  42.86 
 
 
147 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  38.78 
 
 
150 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0015  50S ribosomal protein L9  48.63 
 
 
148 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0015  50S ribosomal protein L9  48.63 
 
 
148 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
147 aa  99  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0691  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
147 aa  99  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.965634  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  37.41 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  42.86 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1029  ribosomal protein L9  40.82 
 
 
148 aa  97.4  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0075177  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
147 aa  97.1  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  34.67 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  34.21 
 
 
178 aa  95.9  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  38.78 
 
 
150 aa  94  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  36.73 
 
 
146 aa  93.6  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
150 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  43.33 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
150 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
150 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  34.67 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  32.65 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  37.25 
 
 
149 aa  92  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  33.56 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  34.23 
 
 
191 aa  91.3  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  40.14 
 
 
149 aa  91.7  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  39.86 
 
 
150 aa  90.9  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  32 
 
 
148 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 
148 aa  90.9  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  34.69 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  32.88 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  35.57 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
160 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  36.84 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  38.24 
 
 
150 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  34.01 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  40.94 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  38.67 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  31.97 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  35.57 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  33.33 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  32.88 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  45.58 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  35.95 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl083  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000770286  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1381  ribosomal protein L9  38.51 
 
 
150 aa  86.3  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  31.51 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  40.27 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5913  ribosomal protein L9  35.37 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  32.65 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>