More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1220 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
148 aa  286  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  85.23 
 
 
149 aa  251  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  62.84 
 
 
147 aa  190  6e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  62.16 
 
 
147 aa  187  5e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  62.16 
 
 
147 aa  186  9e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0691  50S ribosomal protein L9  60.81 
 
 
147 aa  184  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.965634  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  62.84 
 
 
147 aa  179  9.000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1029  ribosomal protein L9  56.76 
 
 
148 aa  160  6e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0075177  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  51.35 
 
 
147 aa  151  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  52.7 
 
 
148 aa  147  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  42.57 
 
 
148 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
148 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  35.81 
 
 
159 aa  102  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
150 aa  100  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 
148 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  38.62 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.6 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  38.1 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  40.56 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1966  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 
148 aa  94.4  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
148 aa  94  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
148 aa  94  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 
148 aa  94  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 
149 aa  94  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  35.14 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  39.87 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1355  ribosomal protein L9  34.93 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  38.31 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  33.78 
 
 
148 aa  90.1  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 
168 aa  90.1  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
153 aa  90.1  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0064  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0015  50S ribosomal protein L9  41.96 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0064  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.452229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0015  50S ribosomal protein L9  41.96 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
149 aa  89  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  33.11 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  34.93 
 
 
146 aa  89  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl083  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000770286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  36.09 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  37.16 
 
 
172 aa  87.4  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  34.44 
 
 
165 aa  87.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  35.42 
 
 
152 aa  87  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  33.11 
 
 
151 aa  87.4  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 
171 aa  87  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  32.43 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  35.37 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  33.77 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  34.69 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  36.18 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  33.79 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  32.43 
 
 
151 aa  84  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 
148 aa  84  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1976  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 
152 aa  84  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  35.57 
 
 
149 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1381  ribosomal protein L9  37.58 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  32.19 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2625  ribosomal protein L9  35.17 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  35.33 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  32.45 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  35.33 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  34.27 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  28.97 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  33.77 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  30.34 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  34.9 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  34.9 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  30.14 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0042  ribosomal protein L9  32.41 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>