More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3773 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3773  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
272 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4155  methionine aminopeptidase, type I  93.01 
 
 
272 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4181  methionine aminopeptidase, type I  72.05 
 
 
259 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4951  Methionyl aminopeptidase  69.4 
 
 
274 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336734  normal  0.305186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3082  methionine aminopeptidase, type I  70.87 
 
 
256 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3065  methionine aminopeptidase, type I  70.47 
 
 
256 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0718466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3125  methionine aminopeptidase, type I  70.47 
 
 
256 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2929  methionine aminopeptidase, type I  65.87 
 
 
255 aa  362  5.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2967  methionine aminopeptidase, type I  69.84 
 
 
253 aa  357  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0391  methionine aminopeptidase, type I  72.05 
 
 
262 aa  352  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1742  methionine aminopeptidase, type I  69.05 
 
 
255 aa  346  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0784  methionine aminopeptidase, type I  68.65 
 
 
255 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3864  methionine aminopeptidase, type I  64.96 
 
 
255 aa  329  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.855634  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2738  methionine aminopeptidase, type I  62.99 
 
 
255 aa  324  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1074  methionine aminopeptidase, type I  61.09 
 
 
257 aa  319  3e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1910  methionine aminopeptidase  58.37 
 
 
260 aa  310  1e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.4212  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3238  methionine aminopeptidase, type I  60.62 
 
 
260 aa  301  8.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4367  methionine aminopeptidase, type I  58.1 
 
 
256 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0991  methionine aminopeptidase, type I  59.84 
 
 
256 aa  286  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.50292  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0075  methionine aminopeptidase, type I  58.89 
 
 
254 aa  281  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1791  methionine aminopeptidase, type I  56.13 
 
 
262 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1430  methionine aminopeptidase, type I  55.34 
 
 
260 aa  278  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36430  methionine aminopeptidase, type I  56.92 
 
 
256 aa  270  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0868  methionine aminopeptidase, type I  56.92 
 
 
260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1739  methionine aminopeptidase, type I  56.3 
 
 
263 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3438  methionine aminopeptidase, type I  52.71 
 
 
264 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000686227  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2802  methionine aminopeptidase, type I  54.15 
 
 
260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0220111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14560  methionine aminopeptidase, type I  49.22 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5400  methionyl aminopeptidase  61.17 
 
 
592 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4211  methionine aminopeptidase, type I  53.36 
 
 
256 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0906  methionine aminopeptidase, type I  46.64 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238805  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1535  methionine aminopeptidase type I  51.38 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.124203  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  45.45 
 
 
255 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24840  methionine aminopeptidase, type I  48.43 
 
 
255 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl145  methionine aminopeptidase  39.37 
 
 
252 aa  191  8e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000374486  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0287  methionine aminopeptidase, type I  38.52 
 
 
257 aa  189  5.999999999999999e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000363229  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  42.06 
 
 
251 aa  188  7e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  42.23 
 
 
259 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  42.06 
 
 
251 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  41.25 
 
 
236 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  41.27 
 
 
248 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  40.08 
 
 
281 aa  185  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  41.27 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  40.94 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  43.36 
 
 
274 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0675  methionine aminopeptidase, type I  38.34 
 
 
251 aa  183  3e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  37.15 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  41.67 
 
 
248 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  41.73 
 
 
255 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  41.5 
 
 
249 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  41.5 
 
 
249 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  40.32 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  40.08 
 
 
249 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0644  methionine aminopeptidase  37.7 
 
 
274 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0269  methionine aminopeptidase, type I  37.8 
 
 
249 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  39.53 
 
 
274 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3984  methionine aminopeptidase, type I  39.47 
 
 
263 aa  176  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405477  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  37.75 
 
 
249 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0604  methionine aminopeptidase, type I  41.27 
 
 
278 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  37.94 
 
 
259 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  40.16 
 
 
256 aa  176  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1134  methionine aminopeptidase, type I  39.53 
 
 
250 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6027  methionine aminopeptidase, type I  39.68 
 
 
279 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  41.34 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  38.34 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5766  methionine aminopeptidase, type I  38.74 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  41.38 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  38.04 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  40.08 
 
 
257 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  37.7 
 
 
250 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  39.76 
 
 
254 aa  172  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  38.8 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  40.77 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  39.92 
 
 
248 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3395  methionine aminopeptidase, type I  43.13 
 
 
264 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  39.68 
 
 
262 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  37.3 
 
 
269 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1048  methionine aminopeptidase, type I  34.85 
 
 
272 aa  171  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  36.65 
 
 
259 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  37.94 
 
 
265 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  39.53 
 
 
259 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  37.55 
 
 
247 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1116  methionine aminopeptidase, type I  37.01 
 
 
250 aa  170  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000848605  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  39.53 
 
 
249 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  38.1 
 
 
248 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  39.29 
 
 
248 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  39.3 
 
 
250 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  37.55 
 
 
256 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  39.37 
 
 
272 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  37.94 
 
 
248 aa  168  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  36.9 
 
 
253 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  39.76 
 
 
277 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0768  methionine aminopeptidase, type I  35.94 
 
 
250 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3306  methionine aminopeptidase, type I  39 
 
 
236 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000948834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4485  methionine aminopeptidase, type I  41.41 
 
 
286 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0955  methionine aminopeptidase, type I  39.42 
 
 
236 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.321891  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  37.25 
 
 
258 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1343  methionine aminopeptidase, type I  34.77 
 
 
256 aa  167  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  37.94 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0884  methionine aminopeptidase, type I  35.69 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.208447  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>