More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3238 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3238  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3864  methionine aminopeptidase, type I  78.85 
 
 
255 aa  410  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.855634  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2738  methionine aminopeptidase, type I  76.45 
 
 
255 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1910  methionine aminopeptidase  65.13 
 
 
260 aa  345  4e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.4212  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3065  methionine aminopeptidase, type I  65.64 
 
 
256 aa  338  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0718466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3125  methionine aminopeptidase, type I  65.64 
 
 
256 aa  338  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3082  methionine aminopeptidase, type I  65.64 
 
 
256 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1074  methionine aminopeptidase, type I  64.75 
 
 
257 aa  338  5.9999999999999996e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4951  Methionyl aminopeptidase  66.15 
 
 
274 aa  336  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336734  normal  0.305186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4181  methionine aminopeptidase, type I  63.85 
 
 
259 aa  332  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445786  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2929  methionine aminopeptidase, type I  60.47 
 
 
255 aa  314  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4155  methionine aminopeptidase, type I  61.78 
 
 
272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3773  methionine aminopeptidase, type I  60.62 
 
 
272 aa  311  5.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1742  methionine aminopeptidase, type I  63.04 
 
 
255 aa  311  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0391  methionine aminopeptidase, type I  63.85 
 
 
262 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0991  methionine aminopeptidase, type I  61.09 
 
 
256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.50292  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4367  methionine aminopeptidase, type I  60.31 
 
 
256 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0075  methionine aminopeptidase, type I  60.38 
 
 
254 aa  300  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0784  methionine aminopeptidase, type I  61.63 
 
 
255 aa  298  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2967  methionine aminopeptidase, type I  61.48 
 
 
253 aa  297  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1791  methionine aminopeptidase, type I  58.37 
 
 
262 aa  293  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1430  methionine aminopeptidase, type I  56.42 
 
 
260 aa  288  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2802  methionine aminopeptidase, type I  59.14 
 
 
260 aa  275  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0220111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14560  methionine aminopeptidase, type I  57.77 
 
 
273 aa  275  8e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36430  methionine aminopeptidase, type I  57.59 
 
 
256 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0868  methionine aminopeptidase, type I  57.2 
 
 
260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1739  methionine aminopeptidase, type I  55.81 
 
 
263 aa  270  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4211  methionine aminopeptidase, type I  60.23 
 
 
256 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3438  methionine aminopeptidase, type I  53.67 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000686227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5400  methionyl aminopeptidase  62.09 
 
 
592 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24840  methionine aminopeptidase, type I  57.53 
 
 
255 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0906  methionine aminopeptidase, type I  50.78 
 
 
255 aa  242  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238805  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1535  methionine aminopeptidase type I  55.81 
 
 
268 aa  238  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.124203  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  47.29 
 
 
255 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  46.36 
 
 
274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  46.07 
 
 
258 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  46.01 
 
 
277 aa  208  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  44.57 
 
 
259 aa  205  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  44.57 
 
 
259 aa  205  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  42.8 
 
 
248 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  42.53 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  45.98 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  44.62 
 
 
269 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  43.97 
 
 
248 aa  198  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  43.89 
 
 
256 aa  198  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  41.15 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  40.77 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  44.36 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  42.91 
 
 
259 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  43.46 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1048  methionine aminopeptidase, type I  40.46 
 
 
272 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  43.09 
 
 
236 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  42.64 
 
 
256 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  41.47 
 
 
249 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  41.47 
 
 
249 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  39.92 
 
 
249 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  39.69 
 
 
249 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0675  methionine aminopeptidase, type I  39.62 
 
 
251 aa  192  6e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  42.59 
 
 
272 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  43.02 
 
 
248 aa  191  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  42.08 
 
 
254 aa  192  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  41.86 
 
 
248 aa  191  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2631  methionine aminopeptidase, type I  42.86 
 
 
277 aa  191  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  38.76 
 
 
249 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  42.15 
 
 
251 aa  190  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1162  methionine aminopeptidase, type I  40.23 
 
 
257 aa  190  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.042748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  41.25 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3984  methionine aminopeptidase, type I  40.86 
 
 
263 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405477  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  40.7 
 
 
249 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  41.76 
 
 
251 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  40.41 
 
 
236 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  41.09 
 
 
250 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  41.8 
 
 
250 aa  188  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  40.86 
 
 
248 aa  188  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  40.7 
 
 
247 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  37.93 
 
 
259 aa  187  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1955  methionine aminopeptidase, type I  47.29 
 
 
264 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl145  methionine aminopeptidase  37.45 
 
 
252 aa  187  2e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000374486  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  41.76 
 
 
251 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2040  methionine aminopeptidase, type I  46.51 
 
 
264 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  40.86 
 
 
281 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  41.86 
 
 
253 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  40 
 
 
261 aa  185  5e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  41.09 
 
 
248 aa  185  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4485  methionine aminopeptidase, type I  44.49 
 
 
286 aa  185  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1048  methionine aminopeptidase  45.57 
 
 
267 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1076  methionine aminopeptidase  45.57 
 
 
267 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1064  methionine aminopeptidase  45.57 
 
 
267 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.304445 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  39.08 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1437  methionine aminopeptidase, type I  40.89 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000252136  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  41.15 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  39.06 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0955  methionine aminopeptidase, type I  40.82 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.321891  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0649  methionine aminopeptidase, type I  42.54 
 
 
288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  39.08 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1924  methionine aminopeptidase, type I  47.67 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0287  methionine aminopeptidase, type I  37.16 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000363229  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23580  methionine aminopeptidase, type I  40.38 
 
 
282 aa  182  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  40.93 
 
 
248 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1516  methionine aminopeptidase  39.37 
 
 
286 aa  182  6e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>