More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4181 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4181  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
259 aa  524  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4951  Methionyl aminopeptidase  83.72 
 
 
274 aa  441  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336734  normal  0.305186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3082  methionine aminopeptidase, type I  76.38 
 
 
256 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3065  methionine aminopeptidase, type I  76.38 
 
 
256 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0718466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3125  methionine aminopeptidase, type I  76.38 
 
 
256 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4155  methionine aminopeptidase, type I  73.23 
 
 
272 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3773  methionine aminopeptidase, type I  72.05 
 
 
272 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0391  methionine aminopeptidase, type I  74.51 
 
 
262 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2929  methionine aminopeptidase, type I  66.27 
 
 
255 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2967  methionine aminopeptidase, type I  71.15 
 
 
253 aa  355  5e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1742  methionine aminopeptidase, type I  71.15 
 
 
255 aa  350  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0784  methionine aminopeptidase, type I  69.84 
 
 
255 aa  338  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2738  methionine aminopeptidase, type I  64.17 
 
 
255 aa  331  5e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3864  methionine aminopeptidase, type I  63.14 
 
 
255 aa  331  7.000000000000001e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.855634  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3238  methionine aminopeptidase, type I  63.85 
 
 
260 aa  321  6e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1074  methionine aminopeptidase, type I  59.92 
 
 
257 aa  317  9e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1910  methionine aminopeptidase  59.53 
 
 
260 aa  317  1e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.4212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4367  methionine aminopeptidase, type I  60.08 
 
 
256 aa  297  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1791  methionine aminopeptidase, type I  58.5 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0991  methionine aminopeptidase, type I  58.66 
 
 
256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.50292  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1430  methionine aminopeptidase, type I  55.98 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0075  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 
254 aa  278  5e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0868  methionine aminopeptidase, type I  58.5 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36430  methionine aminopeptidase, type I  58.5 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2802  methionine aminopeptidase, type I  57.31 
 
 
260 aa  267  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0220111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1739  methionine aminopeptidase, type I  55.12 
 
 
263 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14560  methionine aminopeptidase, type I  51.25 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4211  methionine aminopeptidase, type I  54.55 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3438  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
264 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000686227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5400  methionyl aminopeptidase  60.95 
 
 
592 aa  237  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24840  methionine aminopeptidase, type I  51.38 
 
 
255 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  47.04 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0906  methionine aminopeptidase, type I  45.85 
 
 
255 aa  218  8.999999999999998e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238805  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1535  methionine aminopeptidase type I  48.22 
 
 
268 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.124203  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  45 
 
 
256 aa  206  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  42.91 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  45.14 
 
 
274 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  45.63 
 
 
259 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  40.47 
 
 
262 aa  191  9e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  40 
 
 
249 aa  188  9e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  40.25 
 
 
236 aa  188  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0675  methionine aminopeptidase, type I  38.28 
 
 
251 aa  187  1e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  40.39 
 
 
250 aa  187  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  42.21 
 
 
258 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  40.39 
 
 
250 aa  187  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000159906  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0287  methionine aminopeptidase, type I  37.74 
 
 
257 aa  187  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000363229  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  42.58 
 
 
259 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  41.11 
 
 
248 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  43.36 
 
 
269 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  40.71 
 
 
256 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  40.78 
 
 
249 aa  185  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  41.41 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl145  methionine aminopeptidase  36.08 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000374486  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  40.94 
 
 
255 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1116  methionine aminopeptidase, type I  38.91 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000848605  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  40.71 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  40.71 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  41.86 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  43.31 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  38.89 
 
 
248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  36.9 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  40.86 
 
 
251 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  41.54 
 
 
274 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  40.16 
 
 
249 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1489  methionine aminopeptidase  36.96 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  41.8 
 
 
250 aa  179  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3721  methionine aminopeptidase  38.49 
 
 
248 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  42.46 
 
 
251 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  39.53 
 
 
248 aa  178  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  41.27 
 
 
248 aa  178  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1474  methionine aminopeptidase  36.76 
 
 
248 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.724468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1590  methionine aminopeptidase  36.76 
 
 
248 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  38.74 
 
 
248 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  40.48 
 
 
281 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  37.98 
 
 
264 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  39.13 
 
 
247 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  38.59 
 
 
236 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  35.94 
 
 
259 aa  176  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  40.55 
 
 
248 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0768  methionine aminopeptidase, type I  37.89 
 
 
250 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  39.68 
 
 
250 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0975  methionine aminopeptidase, type I  36.61 
 
 
250 aa  176  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  42.06 
 
 
251 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  39.62 
 
 
257 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5766  methionine aminopeptidase, type I  38.28 
 
 
270 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  37.75 
 
 
249 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  41.41 
 
 
251 aa  176  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf417  methionine aminopeptidase  36.76 
 
 
250 aa  175  5e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1048  methionine aminopeptidase, type I  36.58 
 
 
272 aa  176  5e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2597  methionine aminopeptidase type I  37.3 
 
 
263 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.156772  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1447  methionine aminopeptidase  36.36 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1134  methionine aminopeptidase, type I  39.37 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0644  methionine aminopeptidase  36.11 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  36.51 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2885  methionine aminopeptidase, type I  37.3 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.100664  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  38.19 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  37.55 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1446  methionine aminopeptidase  35.97 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1623  methionine aminopeptidase  35.97 
 
 
248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00675499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  36.58 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>