More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4211 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4211  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
256 aa  494  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3438  methionine aminopeptidase, type I  63.67 
 
 
264 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000686227  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3864  methionine aminopeptidase, type I  59.84 
 
 
255 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.855634  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2738  methionine aminopeptidase, type I  59.45 
 
 
255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3238  methionine aminopeptidase, type I  60.23 
 
 
260 aa  276  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0906  methionine aminopeptidase, type I  54.51 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238805  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3065  methionine aminopeptidase, type I  55.34 
 
 
256 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0718466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3125  methionine aminopeptidase, type I  55.34 
 
 
256 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2929  methionine aminopeptidase, type I  52.94 
 
 
255 aa  265  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3082  methionine aminopeptidase, type I  55.34 
 
 
256 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1074  methionine aminopeptidase, type I  52.55 
 
 
257 aa  265  5.999999999999999e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24840  methionine aminopeptidase, type I  61.42 
 
 
255 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4181  methionine aminopeptidase, type I  54.55 
 
 
259 aa  259  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0075  methionine aminopeptidase, type I  55.34 
 
 
254 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4951  Methionyl aminopeptidase  54.55 
 
 
274 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336734  normal  0.305186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3773  methionine aminopeptidase, type I  53.36 
 
 
272 aa  258  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4155  methionine aminopeptidase, type I  54.15 
 
 
272 aa  257  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1535  methionine aminopeptidase type I  60.47 
 
 
268 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.124203  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1910  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 
260 aa  249  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.4212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  53.73 
 
 
255 aa  248  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0784  methionine aminopeptidase, type I  56.3 
 
 
255 aa  248  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0391  methionine aminopeptidase, type I  55.08 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1742  methionine aminopeptidase, type I  52.96 
 
 
255 aa  241  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4367  methionine aminopeptidase, type I  50.19 
 
 
256 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2967  methionine aminopeptidase, type I  52.57 
 
 
253 aa  234  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1739  methionine aminopeptidase, type I  49.61 
 
 
263 aa  230  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1791  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
262 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0991  methionine aminopeptidase, type I  51.56 
 
 
256 aa  228  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.50292  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1430  methionine aminopeptidase, type I  46.69 
 
 
260 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  49.81 
 
 
259 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36430  methionine aminopeptidase, type I  50.97 
 
 
256 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  47.91 
 
 
258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  48.64 
 
 
277 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2631  methionine aminopeptidase, type I  50.38 
 
 
277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  45.06 
 
 
248 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0868  methionine aminopeptidase, type I  47.67 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2802  methionine aminopeptidase, type I  49.22 
 
 
260 aa  215  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0220111 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  45.82 
 
 
259 aa  211  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  47.45 
 
 
274 aa  210  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1076  methionine aminopeptidase  53.44 
 
 
267 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1048  methionine aminopeptidase  53.44 
 
 
267 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1064  methionine aminopeptidase  53.44 
 
 
267 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.304445 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  43.7 
 
 
248 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  46.09 
 
 
273 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0649  methionine aminopeptidase, type I  48.15 
 
 
288 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  46.27 
 
 
274 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0604  methionine aminopeptidase, type I  48.24 
 
 
278 aa  206  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  44 
 
 
249 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  45.28 
 
 
256 aa  205  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  44.05 
 
 
259 aa  204  9e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  44.81 
 
 
236 aa  204  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1349  methionine aminopeptidase  55.47 
 
 
265 aa  204  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  43.25 
 
 
250 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  49.81 
 
 
271 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  43.65 
 
 
250 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  43.14 
 
 
249 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  43.14 
 
 
249 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6027  methionine aminopeptidase, type I  45.88 
 
 
279 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5020  methionine aminopeptidase  53.7 
 
 
266 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477997  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  42.91 
 
 
256 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  38.98 
 
 
259 aa  202  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  41.73 
 
 
248 aa  201  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  44.31 
 
 
272 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  45.85 
 
 
248 aa  200  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  45.85 
 
 
257 aa  200  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0710  methionine aminopeptidase, type I  48.83 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10748  methionine aminopeptidase  55.08 
 
 
266 aa  199  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.657144  normal  0.278291 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  43.53 
 
 
249 aa  198  5e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  47.2 
 
 
251 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3121  methionine aminopeptidase, type I  48.84 
 
 
276 aa  198  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3395  methionine aminopeptidase, type I  51.91 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  40.71 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  41.11 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0287  methionine aminopeptidase, type I  40.08 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000363229  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1162  methionine aminopeptidase, type I  41.34 
 
 
257 aa  196  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.042748  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  47.64 
 
 
269 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14560  methionine aminopeptidase, type I  45.19 
 
 
273 aa  195  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4293  methionine aminopeptidase, type I  46.44 
 
 
281 aa  195  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143413 
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  43.65 
 
 
251 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1149  methionine aminopeptidase, type I  46.79 
 
 
287 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  43.25 
 
 
251 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3984  methionine aminopeptidase, type I  41.9 
 
 
263 aa  193  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405477  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  42.69 
 
 
248 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0644  methionine aminopeptidase  42.75 
 
 
274 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  39.37 
 
 
248 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1134  methionine aminopeptidase, type I  41.9 
 
 
250 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  42.91 
 
 
262 aa  192  3e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  43.08 
 
 
259 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  42.29 
 
 
255 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  38.98 
 
 
248 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  43.57 
 
 
236 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3901  methionine aminopeptidase, type I  46.92 
 
 
281 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3883  methionine aminopeptidase, type I  44.49 
 
 
272 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  42.46 
 
 
251 aa  192  5e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  38.58 
 
 
248 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  38.58 
 
 
248 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  38.58 
 
 
248 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  38.58 
 
 
248 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  40.71 
 
 
249 aa  192  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  38.58 
 
 
248 aa  192  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>