More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1074 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1074  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1910  methionine aminopeptidase  82.49 
 
 		 260 aa  448  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.4212  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3864  methionine aminopeptidase, type I  66.54 
 
 		 255 aa  343  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.855634  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2738  methionine aminopeptidase, type I  64.2 
 
 		 255 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4951  Methionyl aminopeptidase  62.26 
 
 		 274 aa  328  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336734  normal  0.305186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3238  methionine aminopeptidase, type I  64.75 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3065  methionine aminopeptidase, type I  60.7 
 
 		 256 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0718466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3125  methionine aminopeptidase, type I  60.7 
 
 		 256 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3082  methionine aminopeptidase, type I  60.31 
 
 		 256 aa  321  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3773  methionine aminopeptidase, type I  61.09 
 
 		 272 aa  319  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4181  methionine aminopeptidase, type I  59.92 
 
 		 259 aa  317  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445786  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4155  methionine aminopeptidase, type I  61.48 
 
 		 272 aa  316  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000134834 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4367  methionine aminopeptidase, type I  59.38 
 
 		 256 aa  308  8e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1742  methionine aminopeptidase, type I  60.39 
 
 		 255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1430  methionine aminopeptidase, type I  58.2 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1739  methionine aminopeptidase, type I  60.94 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2929  methionine aminopeptidase, type I  57.42 
 
 		 255 aa  302  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1791  methionine aminopeptidase, type I  58.2 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0391  methionine aminopeptidase, type I  60.31 
 
 		 262 aa  294  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0991  methionine aminopeptidase, type I  58.82 
 
 		 256 aa  294  8e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.50292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36430  methionine aminopeptidase, type I  59.77 
 
 		 256 aa  292  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2967  methionine aminopeptidase, type I  59.61 
 
 		 253 aa  292  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0868  methionine aminopeptidase, type I  58.2 
 
 		 260 aa  281  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2802  methionine aminopeptidase, type I  57.03 
 
 		 260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0220111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0784  methionine aminopeptidase, type I  55.69 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0075  methionine aminopeptidase, type I  53.91 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5400  methionyl aminopeptidase  63.73 
 
 		 592 aa  257  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14560  methionine aminopeptidase, type I  52.23 
 
 		 273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4211  methionine aminopeptidase, type I  52.55 
 
 		 256 aa  245  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3438  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000686227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1535  methionine aminopeptidase type I  49.61 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.124203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0906  methionine aminopeptidase, type I  44.92 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24840  methionine aminopeptidase, type I  50.59 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  46.3 
 
 		 256 aa  208  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  42.58 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  43.92 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  40.47 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  41.6 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  39.61 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  41.25 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  39.53 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  41.63 
 
 		 269 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  38.91 
 
 		 247 aa  181  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  40.39 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  41.96 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0287  methionine aminopeptidase, type I  39 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000363229  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  39.53 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  42.41 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  41.41 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  40.62 
 
 		 249 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  40.33 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  39.3 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  41.47 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  39.53 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  39.3 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  39.3 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000159906  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1116  methionine aminopeptidase, type I  40.91 
 
 		 250 aa  175  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000848605  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  37.89 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  38.82 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  40.86 
 
 		 256 aa  174  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  39.69 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  39.09 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  39.61 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  39.45 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  41.18 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl145  methionine aminopeptidase  37.8 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000374486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  38.22 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  39.22 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  40.86 
 
 		 262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  39.69 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  39.22 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  38.43 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  39.31 
 
 		 259 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  38.43 
 
 		 248 aa  171  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  37.11 
 
 		 248 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  37.89 
 
 		 249 aa  171  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  37.65 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  37.65 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  37.65 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  37.65 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  39.92 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  37.65 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  38.52 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  39.92 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  36.61 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  39.45 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  39.92 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  39.92 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  37.5 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  37.65 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  36.22 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  40.78 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  37.25 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  39.31 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0644  methionine aminopeptidase  38.28 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0675  methionine aminopeptidase, type I  37.65 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  40.08 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  37.25 
 
 		 248 aa  168  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  36.72 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1134  methionine aminopeptidase, type I  39.84 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>