More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2967 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2967  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
253 aa  502  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3082  methionine aminopeptidase, type I  81.42 
 
 
256 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3065  methionine aminopeptidase, type I  81.03 
 
 
256 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0718466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3125  methionine aminopeptidase, type I  81.03 
 
 
256 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0391  methionine aminopeptidase, type I  79.05 
 
 
262 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4951  Methionyl aminopeptidase  71.83 
 
 
274 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336734  normal  0.305186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4181  methionine aminopeptidase, type I  71.15 
 
 
259 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445786  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3773  methionine aminopeptidase, type I  69.84 
 
 
272 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4155  methionine aminopeptidase, type I  70.24 
 
 
272 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000134834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2929  methionine aminopeptidase, type I  67.46 
 
 
255 aa  362  3e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1742  methionine aminopeptidase, type I  69.96 
 
 
255 aa  346  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0784  methionine aminopeptidase, type I  72.22 
 
 
255 aa  342  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2738  methionine aminopeptidase, type I  63.49 
 
 
255 aa  324  9e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3864  methionine aminopeptidase, type I  61.11 
 
 
255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.855634  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1074  methionine aminopeptidase, type I  59.61 
 
 
257 aa  306  3e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4367  methionine aminopeptidase, type I  60.08 
 
 
256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1791  methionine aminopeptidase, type I  60.47 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1910  methionine aminopeptidase  58.43 
 
 
260 aa  299  4e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.4212  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3238  methionine aminopeptidase, type I  61.48 
 
 
260 aa  298  7e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1430  methionine aminopeptidase, type I  57.31 
 
 
260 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0991  methionine aminopeptidase, type I  58.66 
 
 
256 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.50292  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36430  methionine aminopeptidase, type I  58.89 
 
 
256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0868  methionine aminopeptidase, type I  60.08 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0075  methionine aminopeptidase, type I  55.42 
 
 
254 aa  265  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2802  methionine aminopeptidase, type I  56.52 
 
 
260 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0220111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1739  methionine aminopeptidase, type I  54.72 
 
 
263 aa  261  6.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5400  methionyl aminopeptidase  62.68 
 
 
592 aa  248  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3438  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
264 aa  241  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000686227  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14560  methionine aminopeptidase, type I  52.32 
 
 
273 aa  237  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4211  methionine aminopeptidase, type I  52.57 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0906  methionine aminopeptidase, type I  43.48 
 
 
255 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238805  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1535  methionine aminopeptidase type I  50.59 
 
 
268 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.124203  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  44.66 
 
 
255 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  44.62 
 
 
259 aa  201  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  43.7 
 
 
277 aa  198  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  42.69 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  41.67 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  42 
 
 
251 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24840  methionine aminopeptidase, type I  46.64 
 
 
255 aa  196  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  40.87 
 
 
250 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  42.23 
 
 
251 aa  195  7e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  43.7 
 
 
274 aa  194  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  42 
 
 
251 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  41.73 
 
 
256 aa  192  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl145  methionine aminopeptidase  38.34 
 
 
252 aa  192  5e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000374486  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  39.13 
 
 
249 aa  191  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  43.08 
 
 
259 aa  188  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  37.55 
 
 
261 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  41.27 
 
 
281 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  43.31 
 
 
271 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  41.11 
 
 
259 aa  186  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  43.31 
 
 
274 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  41.27 
 
 
269 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  38.74 
 
 
249 aa  185  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  38.74 
 
 
249 aa  185  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  40.71 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  36.76 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  35.2 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  35.06 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0287  methionine aminopeptidase, type I  35.41 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000363229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  40.48 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0675  methionine aminopeptidase, type I  35.43 
 
 
251 aa  182  6e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  38.8 
 
 
248 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  38.34 
 
 
265 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  37.7 
 
 
266 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  39.13 
 
 
256 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  41.96 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1116  methionine aminopeptidase, type I  37.01 
 
 
250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000848605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  38.49 
 
 
267 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  38.34 
 
 
249 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  38.74 
 
 
248 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5766  methionine aminopeptidase, type I  36.36 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  38.17 
 
 
236 aa  178  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  37.85 
 
 
259 aa  178  8e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  35.97 
 
 
266 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  38.19 
 
 
248 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  38.25 
 
 
269 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  41.27 
 
 
262 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  38.25 
 
 
269 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1659  methionine aminopeptidase, type I  36.76 
 
 
260 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.343705 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2597  methionine aminopeptidase type I  35.71 
 
 
263 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.156772  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  35.97 
 
 
248 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  37.7 
 
 
267 aa  176  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  36.76 
 
 
258 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  39.13 
 
 
248 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  36.76 
 
 
255 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  38.89 
 
 
258 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1134  methionine aminopeptidase, type I  37.8 
 
 
250 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  39.53 
 
 
258 aa  175  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  37.35 
 
 
249 aa  175  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3973  methionine aminopeptidase, type I  36.22 
 
 
257 aa  175  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1162  methionine aminopeptidase, type I  37.94 
 
 
257 aa  174  9e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.042748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0644  methionine aminopeptidase  35.92 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1343  methionine aminopeptidase, type I  33.73 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  38.89 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23580  methionine aminopeptidase, type I  42.35 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  36.9 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0085  methionine aminopeptidase, type I  37.55 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  36.08 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  36.76 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>