More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2738 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2738  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 255 aa  513  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3864  methionine aminopeptidase, type I  77.65 
 
 		 255 aa  391  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.855634  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3238  methionine aminopeptidase, type I  76.45 
 
 		 260 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1910  methionine aminopeptidase  65.12 
 
 		 260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.4212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4951  Methionyl aminopeptidase  66.14 
 
 		 274 aa  334  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336734  normal  0.305186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4181  methionine aminopeptidase, type I  64.17 
 
 		 259 aa  331  5e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445786  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1074  methionine aminopeptidase, type I  64.2 
 
 		 257 aa  330  2e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3065  methionine aminopeptidase, type I  64.31 
 
 		 256 aa  327  8e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0718466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3125  methionine aminopeptidase, type I  64.31 
 
 		 256 aa  327  8e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3082  methionine aminopeptidase, type I  63.92 
 
 		 256 aa  325  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4155  methionine aminopeptidase, type I  63.78 
 
 		 272 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3773  methionine aminopeptidase, type I  62.99 
 
 		 272 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2929  methionine aminopeptidase, type I  61.18 
 
 		 255 aa  318  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1742  methionine aminopeptidase, type I  63.1 
 
 		 255 aa  314  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1791  methionine aminopeptidase, type I  62.45 
 
 		 262 aa  308  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2967  methionine aminopeptidase, type I  63.49 
 
 		 253 aa  308  5e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0075  methionine aminopeptidase, type I  62.85 
 
 		 254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4367  methionine aminopeptidase, type I  59.29 
 
 		 256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0391  methionine aminopeptidase, type I  62.99 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1430  methionine aminopeptidase, type I  57.71 
 
 		 260 aa  301  9e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0991  methionine aminopeptidase, type I  60.16 
 
 		 256 aa  292  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.50292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14560  methionine aminopeptidase, type I  59.18 
 
 		 273 aa  282  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0868  methionine aminopeptidase, type I  57.71 
 
 		 260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0784  methionine aminopeptidase, type I  59.29 
 
 		 255 aa  281  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36430  methionine aminopeptidase, type I  58.1 
 
 		 256 aa  280  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2802  methionine aminopeptidase, type I  59.29 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0220111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3438  methionine aminopeptidase, type I  56.47 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000686227  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1739  methionine aminopeptidase, type I  57.48 
 
 		 263 aa  274  8e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4211  methionine aminopeptidase, type I  59.45 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24840  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 		 255 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0906  methionine aminopeptidase, type I  50.59 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5400  methionyl aminopeptidase  61.06 
 
 		 592 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  50.99 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1535  methionine aminopeptidase type I  53.75 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.124203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  48.63 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  46.27 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  47.69 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  47.31 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0287  methionine aminopeptidase, type I  40.62 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000363229  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  45.06 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  46.27 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  44.31 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  44.66 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  44.4 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  41.57 
 
 		 249 aa  198  9e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  41.73 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  42.8 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  44.66 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4485  methionine aminopeptidase, type I  45.53 
 
 		 286 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2631  methionine aminopeptidase, type I  45.38 
 
 		 277 aa  191  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1955  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  41.67 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2040  methionine aminopeptidase, type I  49 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  41.96 
 
 		 281 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  41.6 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  42.29 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  42.52 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  39.53 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  40.23 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  39.84 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  44.49 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1924  methionine aminopeptidase, type I  48.59 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  38.65 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl145  methionine aminopeptidase  38.1 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000374486  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  40.64 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  43.14 
 
 		 273 aa  184  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1076  methionine aminopeptidase  47.1 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1048  methionine aminopeptidase  47.1 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1064  methionine aminopeptidase  47.1 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.304445 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23580  methionine aminopeptidase, type I  44.14 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  39.53 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  40.55 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  40.78 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1349  methionine aminopeptidase  48.23 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  41.27 
 
 		 248 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  38.58 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  41.34 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  40.96 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1116  methionine aminopeptidase, type I  37.55 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000848605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  39.68 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5020  methionine aminopeptidase  46.55 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477997  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  41.11 
 
 		 248 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3022  methionine aminopeptidase, type I  40.48 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0974756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  40.42 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  40.71 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  40.71 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  42.86 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0604  methionine aminopeptidase, type I  43.87 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  38.82 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3395  methionine aminopeptidase, type I  44.62 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1162  methionine aminopeptidase, type I  39.13 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.042748  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0269  methionine aminopeptidase, type I  39.37 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  39.92 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0710  methionine aminopeptidase, type I  44.31 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  40.71 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  42.46 
 
 		 257 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  39.61 
 
 		 269 aa  178  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  38.82 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  39.53 
 
 		 263 aa  178  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  40.32 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>