More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2929 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2929  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
255 aa  528  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3065  methionine aminopeptidase, type I  71.83 
 
 
256 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0718466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3125  methionine aminopeptidase, type I  71.83 
 
 
256 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3082  methionine aminopeptidase, type I  71.43 
 
 
256 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0391  methionine aminopeptidase, type I  71.31 
 
 
262 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4951  Methionyl aminopeptidase  66.67 
 
 
274 aa  364  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336734  normal  0.305186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4181  methionine aminopeptidase, type I  66.27 
 
 
259 aa  363  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445786  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3773  methionine aminopeptidase, type I  65.87 
 
 
272 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4155  methionine aminopeptidase, type I  66.27 
 
 
272 aa  359  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2967  methionine aminopeptidase, type I  67.46 
 
 
253 aa  352  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1742  methionine aminopeptidase, type I  67.46 
 
 
255 aa  352  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0784  methionine aminopeptidase, type I  66.01 
 
 
255 aa  331  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3864  methionine aminopeptidase, type I  61.66 
 
 
255 aa  322  5e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.855634  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2738  methionine aminopeptidase, type I  61.18 
 
 
255 aa  318  5e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1910  methionine aminopeptidase  56.86 
 
 
260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.4212  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3238  methionine aminopeptidase, type I  60.47 
 
 
260 aa  303  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1074  methionine aminopeptidase, type I  57.42 
 
 
257 aa  302  4.0000000000000003e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1791  methionine aminopeptidase, type I  57.03 
 
 
262 aa  293  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4367  methionine aminopeptidase, type I  54.51 
 
 
256 aa  286  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0991  methionine aminopeptidase, type I  55.47 
 
 
256 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.50292  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36430  methionine aminopeptidase, type I  54.9 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1430  methionine aminopeptidase, type I  52.16 
 
 
260 aa  271  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0075  methionine aminopeptidase, type I  52.78 
 
 
254 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2802  methionine aminopeptidase, type I  54.51 
 
 
260 aa  264  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0220111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0868  methionine aminopeptidase, type I  52.94 
 
 
260 aa  261  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4211  methionine aminopeptidase, type I  52.94 
 
 
256 aa  252  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1739  methionine aminopeptidase, type I  51.95 
 
 
263 aa  250  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3438  methionine aminopeptidase, type I  47.84 
 
 
264 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000686227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5400  methionyl aminopeptidase  56.87 
 
 
592 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0906  methionine aminopeptidase, type I  44.71 
 
 
255 aa  228  6e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238805  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14560  methionine aminopeptidase, type I  45.49 
 
 
273 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  42.35 
 
 
255 aa  215  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24840  methionine aminopeptidase, type I  47.24 
 
 
255 aa  211  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1535  methionine aminopeptidase type I  45.85 
 
 
268 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.124203  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  40.16 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  42.37 
 
 
259 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  40.94 
 
 
256 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  40.78 
 
 
274 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  42.06 
 
 
257 aa  191  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl145  methionine aminopeptidase  37.3 
 
 
252 aa  190  2e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000374486  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0287  methionine aminopeptidase, type I  37.11 
 
 
257 aa  189  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000363229  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  39.37 
 
 
250 aa  189  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000159906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  39.37 
 
 
250 aa  189  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  42.8 
 
 
251 aa  188  8e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  40.48 
 
 
255 aa  188  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  42.8 
 
 
251 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  38.82 
 
 
269 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  42.8 
 
 
251 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  40.71 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  38.67 
 
 
256 aa  181  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  40 
 
 
274 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  39.37 
 
 
262 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0644  methionine aminopeptidase  36.03 
 
 
274 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2885  methionine aminopeptidase, type I  37.7 
 
 
265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.100664  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  40.08 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  37.3 
 
 
259 aa  179  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1116  methionine aminopeptidase, type I  37.4 
 
 
250 aa  178  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000848605  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  36.76 
 
 
251 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  35.97 
 
 
264 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  37.4 
 
 
262 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0675  methionine aminopeptidase, type I  34.39 
 
 
251 aa  177  2e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  38.55 
 
 
251 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  39.92 
 
 
259 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  36.61 
 
 
258 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  34.65 
 
 
266 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1437  methionine aminopeptidase, type I  38.37 
 
 
262 aa  176  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000252136  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2597  methionine aminopeptidase type I  36.9 
 
 
263 aa  175  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.156772  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  38.1 
 
 
254 aa  175  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3984  methionine aminopeptidase, type I  35.32 
 
 
263 aa  175  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405477  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  37.89 
 
 
277 aa  175  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  38.06 
 
 
253 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  37.35 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  34.78 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  37.15 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  38.67 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  36.9 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  36.76 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  37.75 
 
 
259 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  36.51 
 
 
248 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1162  methionine aminopeptidase, type I  34.78 
 
 
257 aa  171  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.042748  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0269  methionine aminopeptidase, type I  37.8 
 
 
249 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  39.13 
 
 
250 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  36.08 
 
 
281 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  35.94 
 
 
253 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2275  methionine aminopeptidase, type I  33.98 
 
 
258 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  hitchhiker  0.00333924 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1385  methionine aminopeptidase  37.89 
 
 
285 aa  170  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  35.57 
 
 
248 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  37.3 
 
 
248 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1756  methionine aminopeptidase  34.51 
 
 
252 aa  169  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0318499  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1343  methionine aminopeptidase, type I  33.86 
 
 
256 aa  169  4e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  37.15 
 
 
249 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  37.15 
 
 
249 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf417  methionine aminopeptidase  33.6 
 
 
250 aa  168  7e-41  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  35.57 
 
 
248 aa  168  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  35.16 
 
 
253 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0086  methionine aminopeptidase  35.8 
 
 
251 aa  167  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  37.3 
 
 
250 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0604  methionine aminopeptidase, type I  37.4 
 
 
278 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1955  methionine aminopeptidase, type I  39.04 
 
 
264 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0975  methionine aminopeptidase, type I  34.39 
 
 
250 aa  166  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>