110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2964 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2964  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000002161  normal  0.0760425 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2795  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 325 aa  99  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3783  Glycosyltransferase-like protein  27.65 
 
 		 313 aa  86.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1863  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0035646  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4578  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.465031  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1065  Glycosyltransferase-like protein  27.2 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3017  glycosyl transferase group 1  22.48 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0432  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1139  glycosyl transferase group 1  21.52 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  28.35 
 
 		 417 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  26.86 
 
 		 397 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 		 373 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3285  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.514132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  32.59 
 
 		 406 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.11 
 
 		 373 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 361 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 426 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  39.77 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3907  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 370 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 393 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 405 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  21.48 
 
 		 414 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 370 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  38.27 
 
 		 406 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 		 388 aa  49.3  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5261  glycosyl transferase group 1  20 
 
 		 323 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.756426  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 409 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2021  glycosyl transferase group 1  22.44 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0243957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  21.76 
 
 		 374 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  21.76 
 
 		 374 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  21.76 
 
 		 374 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 419 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  47.92 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 		 362 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 		 395 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 		 387 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 		 408 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 		 388 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0356  glycosyl transferase, group 1  41.67 
 
 		 395 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 		 385 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 		 378 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 424 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 402 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  29.66 
 
 		 392 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  30.43 
 
 		 371 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 		 402 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  36.05 
 
 		 423 aa  46.6  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 343 aa  46.2  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 		 405 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 426 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 		 378 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 		 376 aa  45.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 361 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 391 aa  45.8  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 401 aa  45.8  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0756  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 		 415 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 425 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  21.71 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  29.35 
 
 		 371 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3395  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 431 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 358 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  36.59 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 411 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4023  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 413 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 		 371 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  41.67 
 
 		 351 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0966  glycosyl transferase group 1  19.73 
 
 		 382 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0155699  normal  0.836168 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2505  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 409 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 402 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 		 382 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0474  Glycosyltransferase-like protein  24.21 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.97 
 
 		 390 aa  43.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 420 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  31.58 
 
 		 424 aa  43.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 390 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  32.65 
 
 		 426 aa  43.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2399  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 		 996 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.969384  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  20.9 
 
 		 346 aa  42.7  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 		 370 aa  42.7  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  43.75 
 
 		 403 aa  42.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  21.32 
 
 		 390 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>