80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1570 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1570  methyltransferase type 11  100 
 
 		 318 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000565809  hitchhiker  0.0000234255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2479  methyltransferase type 11  48.9 
 
 		 335 aa  324  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0780239  hitchhiker  0.0000664999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2627  methyltransferase type 11  46.01 
 
 		 319 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000222743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2991  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0353144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.85 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.78 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.11 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.58 
 
 		 265 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  33.96 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1141  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2080  MCP methyltransferase, CheR-type  24.14 
 
 		 825 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646014  normal  0.992336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.91 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2018  MCP methyltransferase, CheR-type  23.13 
 
 		 865 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854917  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0046  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 236 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.260962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  27.97 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  28.68 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0777  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.621905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.5 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  29.38 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1392  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.07 
 
 		 272 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1927  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170226  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  30 
 
 		 276 aa  46.6  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 271 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 245 aa  46.2  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  31.3 
 
 		 263 aa  45.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0381  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 200 aa  45.8  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_345  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.37 
 
 		 200 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0977  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.45 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.610826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.85 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.28 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1809  methyltransferase type 11  24.07 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.171878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  23.28 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.32 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0402  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.09 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  23.6 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  30.91 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  25.48 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  24.6 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 415 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.35 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.18 
 
 		 244 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.81 
 
 		 235 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  27.87 
 
 		 257 aa  43.5  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  24.22 
 
 		 273 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0894  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.21 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000138444  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.46 
 
 		 241 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 285 aa  43.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.46 
 
 		 241 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 259 aa  42.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.71 
 
 		 219 aa  43.1  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0867  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.35 
 
 		 243 aa  43.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0796  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.35 
 
 		 243 aa  43.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 259 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.61 
 
 		 233 aa  42.7  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 280 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 259 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 273 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.19 
 
 		 210 aa  42.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.28 
 
 		 272 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  30.48 
 
 		 341 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  44.19 
 
 		 256 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  22.02 
 
 		 269 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.3 
 
 		 254 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>