82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5121 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5121  Transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0287  FMN-binding negative transcriptional regulator  54.63 
 
 		 231 aa  228  4e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00581464  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02790  transcriptional regulator  51.89 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3100  transcriptional regulator protein  44.76 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2794  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2445  negative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0716  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0823  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00293061  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.84 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0540  negative transcriptional regulator  26.78 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05365  normal  0.138094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0835  negative transcriptional regulator  27.81 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971312  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3982  negative transcriptional regulator  29.73 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2039  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  24.42 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5889  FMN-binding negative transcriptional regulator  22.1 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  27.84 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5075  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5144  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.84 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6892  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.65 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199077  normal  0.214366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1332  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.38 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1673  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2006  transcriptional regulator, putative  26.63 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0083  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.77 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0395  FMN-binding negative transcriptional regulator  24.22 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2937  negative transcriptional regulator  28.11 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2433  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00303402  hitchhiker  0.0000000627876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2763  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2807  transcriptional regulator, putative  26.63 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.233937  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0096  flavin-nucleotide-binding protein  19.19 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000283829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3532  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  24.74 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.98 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0320  negative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2595  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.596063  normal  0.387645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3744  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.25 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0396  negative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3644  transcriptional regulator protein  29.71 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3223  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.86 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.690612  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5850  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.57 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5016  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.63 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.213786  normal  0.76718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1658  negative transcriptional regulator  23.53 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4524  negative transcriptional regulator  26.97 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00396175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4171  negative transcriptional regulator  27.84 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3457  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0910  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3490  Negative transcriptional regulator  25.88 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2973  negative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4832  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.88 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3225  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  25.49 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.63 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3032  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.17 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3265  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.17 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4787  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2455  negative transcriptional regulator  30.12 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.361522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09790  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  22.73 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1405  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.81 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5257  negative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2431  negative transcriptional regulator  24.04 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3110  negative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0091  FMN-binding negative transcriptional regulator  21.61 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6076  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.06 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.71 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.02519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.95 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0044  GCN5-related N-acetyltransferase  31 
 
 		 355 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3571  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.71 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2953  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.93 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.636626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3311  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.71 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.262888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2769  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2440  negative transcriptional regulator  27 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0623285  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1661  negative transcriptional regulator  24.38 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0048  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 		 359 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0853  negative transcriptional regulator  23.08 
 
 		 205 aa  42.4  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4597  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 212 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3937  hypothetical protein  22.67 
 
 		 222 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.479682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  26.83 
 
 		 212 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>