80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0287 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0287  FMN-binding negative transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00581464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5121  Transcriptional regulator-like protein  54.63 
 
 		 215 aa  228  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02790  transcriptional regulator  53.77 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3100  transcriptional regulator protein  42.86 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0823  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.84 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00293061  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.01 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.49 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0540  negative transcriptional regulator  31.95 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05365  normal  0.138094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5889  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0395  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.99 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.26 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2445  negative transcriptional regulator  28.66 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.03 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1332  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.82 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2794  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.33 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0716  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.11 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0835  negative transcriptional regulator  30.66 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971312  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.94 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.78 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0910  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09790  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6892  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199077  normal  0.214366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0091  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.49 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4524  negative transcriptional regulator  30.68 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00396175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  31.61 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6596  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.89 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127183  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5144  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.61 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2039  hypothetical protein  29.83 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2937  negative transcriptional regulator  27.75 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3744  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.58 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  25.25 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1155  negative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01760  hypothetical protein  31.11 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3457  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3490  Negative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4832  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.6 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2431  negative transcriptional regulator  25.46 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0092  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.41 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5850  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  28.3 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2821  transcriptional regulator, putative  30.51 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1106  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  19.79 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0396  negative transcriptional regulator  27.57 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4171  negative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5016  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.29 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.213786  normal  0.76718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0083  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.74 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3110  negative transcriptional regulator  30.29 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0853  negative transcriptional regulator  30.36 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5257  negative transcriptional regulator  30.29 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50195  predicted protein  25.14 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.273335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2440  negative transcriptional regulator  27.49 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0623285  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4597  FMN-binding negative transcriptional regulator  24.85 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1949  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 		 361 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494681  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3062  transcriptional regulator, putative  30.06 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1228  putative transcriptional regulator  30.06 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0639  putative transcriptional regulator  30.06 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1557  transcriptional regulator PaiB-like protein  30.77 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204051  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0514  putative transcriptional regulator  30.06 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1455  FMN-binding domain-containing protein  30.06 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2838  negative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0668939  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1423  FMN-binding domain-containing protein  30.06 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2223  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2006  transcriptional regulator, putative  26.92 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1673  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4787  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.77 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3464  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.11 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.272985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0320  negative transcriptional regulator  27.42 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4536  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.11 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.856573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  24.42 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2407  negative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.103505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2334  negative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0188338  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3276  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  26.98 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0785112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  26.98 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5118  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000184887  normal  0.127923 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3253  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  26.19 
 
 		 207 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  23.98 
 
 		 199 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3644  transcriptional regulator protein  27.56 
 
 		 212 aa  42  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>