48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02790 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02790  transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0287  FMN-binding negative transcriptional regulator  53.77 
 
 		 231 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00581464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5121  Transcriptional regulator-like protein  51.89 
 
 		 215 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3100  transcriptional regulator protein  43.6 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0395  FMN-binding negative transcriptional regulator  24.85 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0320  negative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0823  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00293061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4489  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.28 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2006  transcriptional regulator, putative  29.61 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1673  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2433  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00303402  hitchhiker  0.0000000627876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2763  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2807  transcriptional regulator, putative  28.95 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.233937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.88 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3744  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.5 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  24.39 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.69 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.93 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0853  negative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  23.15 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0540  negative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05365  normal  0.138094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4597  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.55 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0131  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.81 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6892  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.63 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199077  normal  0.214366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.68 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2937  negative transcriptional regulator  31.21 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2838  negative transcriptional regulator  28.73 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0668939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6076  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.88 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1949  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 		 361 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0275  negative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594714  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0835  negative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971312  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1332  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2445  negative transcriptional regulator  26.45 
 
 		 212 aa  45.1  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3982  negative transcriptional regulator  26.58 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0083  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2719  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.26 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.73362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5118  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.48 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000184887  normal  0.127923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2824  negative transcriptional regulator  28.14 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5075  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.34 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2440  negative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0623285  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2973  negative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  26.71 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3644  transcriptional regulator protein  32.39 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>