More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0722 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0722  histidine kinase  100 
 
 
340 aa  665    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1089  histidine kinase  55.43 
 
 
353 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1196  ATPase domain-containing protein  56.21 
 
 
343 aa  297  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0133  histidine kinase  47.16 
 
 
375 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759168  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.29 
 
 
331 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8287  histidine kinase  43.81 
 
 
386 aa  242  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1194  histidine kinase  54.26 
 
 
341 aa  242  7.999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.991279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.13 
 
 
340 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 
344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0722  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 
344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0142895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0702  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 
344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.305923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 
379 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3087  histidine kinase  41.44 
 
 
392 aa  219  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0770082  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
413 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0604808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
582 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
604 aa  145  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
468 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
621 aa  142  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
585 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
600 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
380 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
607 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
487 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
597 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
815 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
470 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
591 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
597 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  33.33 
 
 
463 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
593 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
585 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
625 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
723 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
590 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
453 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
571 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
621 aa  130  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  33.19 
 
 
468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  39.91 
 
 
482 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  37.55 
 
 
486 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  35.74 
 
 
581 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
518 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  34.48 
 
 
257 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  35.74 
 
 
518 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
612 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
504 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1517  sensor histidine kinase  28.84 
 
 
604 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  36.4 
 
 
467 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  36.4 
 
 
467 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.4 
 
 
467 aa  126  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3828  sensor histidine kinase  28.46 
 
 
604 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000117767 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  36.4 
 
 
467 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.4 
 
 
467 aa  126  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  37.18 
 
 
423 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
587 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
623 aa  125  8.000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
377 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  34.16 
 
 
496 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  36.6 
 
 
581 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
584 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5610  histidine kinase  33.99 
 
 
344 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
469 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  39.73 
 
 
369 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
581 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
509 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
446 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
369 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
438 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  35.9 
 
 
376 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
412 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  32.19 
 
 
587 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
584 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  32.19 
 
 
587 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.96 
 
 
467 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  32.19 
 
 
587 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  34.58 
 
 
356 aa  124  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  36.05 
 
 
593 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  32.19 
 
 
587 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  32.19 
 
 
587 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.96 
 
 
467 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
412 aa  123  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
418 aa  123  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  30.9 
 
 
508 aa  123  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
350 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  32.19 
 
 
587 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0437  histidine kinase  29.41 
 
 
377 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1359  sensor histidine kinase  31.56 
 
 
591 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.805336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  28.46 
 
 
603 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  32.77 
 
 
446 aa  123  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1638  sensor histidine kinase ResE  30.69 
 
 
591 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>