More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1442 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
413 aa  818    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0604808  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3087  histidine kinase  41.39 
 
 
392 aa  249  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0770082  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8287  histidine kinase  41.33 
 
 
386 aa  246  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0133  histidine kinase  39.95 
 
 
375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759168  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0722  histidine kinase  34.62 
 
 
340 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1089  histidine kinase  36.2 
 
 
353 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 
379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1196  ATPase domain-containing protein  42.68 
 
 
343 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
413 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
340 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  31.85 
 
 
352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
331 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1194  histidine kinase  35.74 
 
 
341 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.991279 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.17 
 
 
512 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
509 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
723 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  32.01 
 
 
593 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
641 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
344 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0722  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
344 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0142895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0702  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
344 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.305923 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
466 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
590 aa  123  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  24.92 
 
 
508 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  32.65 
 
 
594 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
476 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
596 aa  121  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
590 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  30.63 
 
 
501 aa  119  7e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  27 
 
 
603 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
467 aa  119  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
585 aa  119  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
640 aa  119  9e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
473 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
524 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
593 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  24.28 
 
 
310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
471 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0256  sensor histidine kinase  24.72 
 
 
615 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
425 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  31.19 
 
 
539 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  28.92 
 
 
482 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1517  sensor histidine kinase  27 
 
 
604 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
587 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  29.24 
 
 
490 aa  116  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  27.91 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
601 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  27.35 
 
 
587 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3828  sensor histidine kinase  27 
 
 
604 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000117767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  27.35 
 
 
587 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2910  histidine kinase  25.86 
 
 
594 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
614 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5470  histidine kinase  24.72 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0102378  hitchhiker  0.00183313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
600 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  27 
 
 
603 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  32.2 
 
 
485 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
639 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  24.44 
 
 
473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  26.94 
 
 
587 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4545  sensor histidine kinase  23.62 
 
 
617 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  26.94 
 
 
587 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 
446 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  31.19 
 
 
423 aa  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  27.66 
 
 
337 aa  113  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3041  two-component sensor histidine kinase, phosphate regulation  24 
 
 
350 aa  113  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.575064  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  28.89 
 
 
906 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  26.62 
 
 
603 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  26.94 
 
 
587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
639 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  30.2 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  26.94 
 
 
587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2656  histidine kinase  29.77 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.265669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3459  histidine kinase  29.77 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  26.94 
 
 
587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  26.94 
 
 
587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04720  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0135462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  26.94 
 
 
587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1870  sensor protein VanS  25.08 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
585 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 
384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
1043 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 
666 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 
666 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  27.34 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 
470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1371  sensor histidine kinase  26.24 
 
 
603 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1554  sensor histidine kinase  26.24 
 
 
603 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  26.24 
 
 
603 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1343  sensor histidine kinase  26.24 
 
 
603 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.830761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  26.24 
 
 
603 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 
639 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  28.71 
 
 
540 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.805184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>