More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1194 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1194  histidine kinase  100 
 
 
341 aa  664    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.991279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0722  histidine kinase  54.57 
 
 
340 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1089  histidine kinase  59.32 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1196  ATPase domain-containing protein  59.16 
 
 
343 aa  286  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
340 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.61 
 
 
331 aa  265  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.85 
 
 
344 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0722  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.85 
 
 
344 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0142895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0702  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.85 
 
 
344 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.305923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0133  histidine kinase  61.11 
 
 
375 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759168  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.04 
 
 
379 aa  235  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8287  histidine kinase  56.45 
 
 
386 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3087  histidine kinase  51.24 
 
 
392 aa  215  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0770082  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0604808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
453 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
596 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
604 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
473 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
380 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
467 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
593 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
607 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
600 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  35.42 
 
 
496 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
585 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 
483 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  33.9 
 
 
587 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
394 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  33.47 
 
 
587 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  33.47 
 
 
587 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  33.47 
 
 
587 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
592 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  33.9 
 
 
587 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
589 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  33.47 
 
 
587 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  33.47 
 
 
587 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
597 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
597 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 
483 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
444 aa  137  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
585 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
591 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
590 aa  135  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  33.05 
 
 
587 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 
723 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  33.05 
 
 
587 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  32.23 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  32.23 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  34.43 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
581 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  32.23 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
524 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
581 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
608 aa  133  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
592 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
582 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
389 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
515 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
489 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
379 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
379 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  38.19 
 
 
518 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
518 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  41.05 
 
 
594 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4691  histidine kinase  32.28 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  42.49 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  34.02 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
815 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
379 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
471 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
621 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
385 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
590 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
892 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
1010 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  35.81 
 
 
537 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4604  sensor histidine kinase  33.2 
 
 
368 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1143  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
584 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
584 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  33.06 
 
 
906 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
587 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
470 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  36.13 
 
 
581 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
628 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>