35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0898 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0898  Type IV secretory pathway TrbF protein-like protein  100 
 
 		 234 aa  462  1e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1190  hypothetical protein  76.07 
 
 		 234 aa  364  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1191  hypothetical protein  67.74 
 
 		 97 aa  94  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2345  Conjugal transfer protein  25.26 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2033  conjugal transfer protein TrbF  26.53 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5216  conjugal transfer protein TrbF  24.85 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1841  conjugal transfer protein TrbF  26.26 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.377716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5369  conjugal transfer protein TrbF  23.88 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682768  normal  0.410714 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1713  Conjugal transfer protein  20.22 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000549304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2353  Conjugal transfer protein  21.89 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.744768  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4562  conjugal transfer protein TrbF  23.79 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2692  conjugal transfer protein TrbF  23.94 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0792392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2904  conjugal transfer protein TrbF  24.46 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.071912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2651  conjugal transfer protein TrbF  24.46 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0552472  normal  0.84636 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2317  conjugal transfer protein TrbF  21.35 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.643073  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3499  conjugal transfer protein TrbF  24.46 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5383  conjugal transfer protein TrbF  22.06 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8326  conjugal transfer protein TrbF  22.44 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.029334  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9260  conjugal transfer protein TrbF  23.67 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0502  conjugal transfer protein TrbF  21.35 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0478499  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5489  conjugal transfer protein TrbF  22.89 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0692  conjugal transfer protein TrbF  21.43 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1665  Conjugal transfer protein  22.66 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9651  conjugal transfer protein TrbF  23.71 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39699  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2093  conjugal transfer protein TrbF  21.65 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0618543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6631  conjugal transfer protein TrbF  21.65 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0149  conjugal transfer protein TrbF  21.67 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6506  conjugal transfer protein TrbF  21.65 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4270  conjugal transfer protein TrbF  21.65 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117817  normal  0.0324718 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3201  conjugal transfer protein TrbF  21.43 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7748  conjugal transfer protein TrbF  21.16 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520847  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3548  conjugal transfer protein TrbF  22.54 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1187  conjugal transfer protein TrbF  22.54 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0960  conjugal transfer protein TrbF  22.79 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3093  conjugal transfer protein TrbF  24.22 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>