83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5369 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5369  conjugal transfer protein TrbF  100 
 
 		 227 aa  463  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682768  normal  0.410714 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5216  conjugal transfer protein TrbF  59.38 
 
 		 228 aa  267  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2831  conjugal transfer protein TrbF  42.73 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.571124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3993  conjugal transfer protein TrbF  41.41 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0169499  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3219  conjugal transfer protein TrbF  42.73 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00389999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7748  conjugal transfer protein TrbF  41.96 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520847  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3858  conjugal transfer protein TrbF  43.17 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00683431  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0602  conjugal transfer protein TrbF  40.53 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2093  conjugal transfer protein TrbF  40.97 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0618543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0502  conjugal transfer protein TrbF  41.41 
 
 		 229 aa  198  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0478499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2692  conjugal transfer protein TrbF  41.07 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0792392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1289  conjugal transfer protein TrbF  41.52 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3698  conjugal transfer protein TrbF  40.62 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30870  conjugal transfer protein TrbF  40.18 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177985  unclonable  2.25295e-22 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2577  conjugal transfer protein TrbF  41.07 
 
 		 234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.756433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35650  conjugal transfer protein TrbF  41.52 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109489  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2011  conjugal transfer protein TrbF  41.96 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1902  conjugal transfer protein TrbF  39.73 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.617323  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1348  conjugal transfer protein TrbF  40.18 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000109379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3499  conjugal transfer protein TrbF  41.52 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2357  conjugal transfer protein TrbF  41.96 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.109686  normal  0.258524 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2651  conjugal transfer protein TrbF  41.07 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0552472  normal  0.84636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0431  conjugal transfer protein TrbF  41.07 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3699  conjugal transfer protein TrbF  40.18 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2317  conjugal transfer protein TrbF  40.09 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.643073  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1323  conjugal transfer protein TrbF  39.73 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1477  conjugal transfer protein TrbF  41.41 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0985827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3093  conjugal transfer protein TrbF  40.18 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3201  conjugal transfer protein TrbF  39.21 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0311  conjugal transfer protein TrbF  40.18 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1187  conjugal transfer protein TrbF  40.53 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3548  conjugal transfer protein TrbF  40.53 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0733  conjugal transfer protein TrbF  39.73 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1841  conjugal transfer protein TrbF  40.18 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.377716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2997  conjugal transfer protein TrbF  39.29 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0692  conjugal transfer protein TrbF  40.09 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1557  conjugal transfer protein TrbF  39.73 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000776204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2904  conjugal transfer protein TrbF  39.73 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.071912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1146  conjugal transfer protein TrbF  41.96 
 
 		 234 aa  188  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3534  conjugal transfer protein TrbF  39.29 
 
 		 227 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776312  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0149  conjugal transfer protein TrbF  39.21 
 
 		 229 aa  187  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1506  conjugal transfer protein TrbF  38.39 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3834  conjugal transfer protein TrbF  38.84 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1487  conjugal transfer protein TrbF  40.62 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3894  conjugal transfer protein TrbF  38.39 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1006  conjugal transfer protein TrbF  40.18 
 
 		 226 aa  184  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0742  conjugal transfer protein TrbF  40.62 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4201  conjugal transfer protein TrbF  38.39 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.902696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7447  conjugal transfer protein TrbF  37.95 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0960  conjugal transfer protein TrbF  37.95 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3371  conjugal transfer protein TrbF  38.39 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2885  conjugal transfer protein TrbF  40.62 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2607  conjugal transfer protein TrbF  39.29 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2345  Conjugal transfer protein  37.55 
 
 		 232 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2479  conjugal transfer protein TrbF  37.95 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.901597  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2033  conjugal transfer protein TrbF  37.67 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0168  conjugal transfer protein TrbF  35.24 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577326  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2274  conjugal transfer protein TrbF  36.28 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.736535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1713  Conjugal transfer protein  35.05 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000549304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2353  Conjugal transfer protein  34.91 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.744768  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8326  conjugal transfer protein TrbF  27.6 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.029334  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4562  conjugal transfer protein TrbF  27.15 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6506  conjugal transfer protein TrbF  31.22 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9651  conjugal transfer protein TrbF  27.85 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39699  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4270  conjugal transfer protein TrbF  30.67 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117817  normal  0.0324718 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6631  conjugal transfer protein TrbF  30.77 
 
 		 260 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5383  conjugal transfer protein TrbF  27.73 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9260  conjugal transfer protein TrbF  25.79 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399754  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1392  conjugal transfer protein  32.88 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1694  conjugal transfer protein  32.88 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194664  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5489  conjugal transfer protein TrbF  25.91 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2509  conjugal transfer protein  29.49 
 
 		 217 aa  92  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal  0.64897 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1665  Conjugal transfer protein  27.16 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0256  conjugal transfer protein  32.43 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0051  conjugal transfer protein TrbF  22.97 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4695  conjugal transfer protein TrbF  26.89 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1190  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2229  conjugal transfer protein TrbF  22.27 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373405  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0898  Type IV secretory pathway TrbF protein-like protein  23.88 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2824  Type IV secretory pathway TrbF protein-like protein  19.7 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5457  Type IV secretory pathway component VirB8-like  22.17 
 
 		 256 aa  52  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0195796 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4754  hypothetical protein  23.66 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.26139 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1084  conjugal transfer protein  46.51 
 
 		 56 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>