79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2033 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2033  conjugal transfer protein TrbF  100 
 
 		 261 aa  529  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1289  conjugal transfer protein TrbF  55.13 
 
 		 234 aa  259  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0431  conjugal transfer protein TrbF  54.27 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2904  conjugal transfer protein TrbF  53.85 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.071912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2651  conjugal transfer protein TrbF  53.85 
 
 		 234 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0552472  normal  0.84636 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1841  conjugal transfer protein TrbF  53.68 
 
 		 232 aa  255  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.377716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2692  conjugal transfer protein TrbF  53.85 
 
 		 234 aa  254  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0792392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3499  conjugal transfer protein TrbF  53.42 
 
 		 234 aa  254  9e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30870  conjugal transfer protein TrbF  53.42 
 
 		 234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177985  unclonable  2.25295e-22 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2577  conjugal transfer protein TrbF  53.85 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.756433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3699  conjugal transfer protein TrbF  52.99 
 
 		 234 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0733  conjugal transfer protein TrbF  52.56 
 
 		 234 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1348  conjugal transfer protein TrbF  52.99 
 
 		 234 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000109379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1902  conjugal transfer protein TrbF  53.85 
 
 		 234 aa  251  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.617323  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2011  conjugal transfer protein TrbF  52.99 
 
 		 234 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264252  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4201  conjugal transfer protein TrbF  52.14 
 
 		 234 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.902696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1557  conjugal transfer protein TrbF  52.14 
 
 		 234 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000776204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1323  conjugal transfer protein TrbF  52.14 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2357  conjugal transfer protein TrbF  52.99 
 
 		 234 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.109686  normal  0.258524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7447  conjugal transfer protein TrbF  53.81 
 
 		 226 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2831  conjugal transfer protein TrbF  53.81 
 
 		 229 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.571124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35650  conjugal transfer protein TrbF  52.99 
 
 		 234 aa  245  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109489  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2607  conjugal transfer protein TrbF  52.47 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3093  conjugal transfer protein TrbF  50.22 
 
 		 227 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3894  conjugal transfer protein TrbF  49.78 
 
 		 226 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3698  conjugal transfer protein TrbF  52.91 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1487  conjugal transfer protein TrbF  50.22 
 
 		 226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2997  conjugal transfer protein TrbF  49.33 
 
 		 227 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3993  conjugal transfer protein TrbF  50.22 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0169499  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3858  conjugal transfer protein TrbF  52.02 
 
 		 229 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00683431  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0311  conjugal transfer protein TrbF  51.33 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1146  conjugal transfer protein TrbF  52.44 
 
 		 234 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3534  conjugal transfer protein TrbF  50.22 
 
 		 227 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776312  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0692  conjugal transfer protein TrbF  49.33 
 
 		 229 aa  232  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0602  conjugal transfer protein TrbF  49.33 
 
 		 229 aa  231  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1506  conjugal transfer protein TrbF  50.22 
 
 		 227 aa  231  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2093  conjugal transfer protein TrbF  49.78 
 
 		 228 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0618543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3834  conjugal transfer protein TrbF  48.43 
 
 		 227 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3219  conjugal transfer protein TrbF  47.98 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00389999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1187  conjugal transfer protein TrbF  47.53 
 
 		 229 aa  228  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3548  conjugal transfer protein TrbF  47.53 
 
 		 229 aa  228  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2317  conjugal transfer protein TrbF  50.22 
 
 		 229 aa  228  9e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.643073  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1006  conjugal transfer protein TrbF  50.22 
 
 		 226 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0960  conjugal transfer protein TrbF  49.78 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1477  conjugal transfer protein TrbF  48.43 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0985827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3201  conjugal transfer protein TrbF  49.33 
 
 		 229 aa  225  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3371  conjugal transfer protein TrbF  49.33 
 
 		 227 aa  224  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2479  conjugal transfer protein TrbF  51.57 
 
 		 227 aa  222  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.901597  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2885  conjugal transfer protein TrbF  49.33 
 
 		 227 aa  221  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7748  conjugal transfer protein TrbF  50.22 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520847  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0502  conjugal transfer protein TrbF  48.88 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0478499  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0742  conjugal transfer protein TrbF  47.98 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0149  conjugal transfer protein TrbF  47.53 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2274  conjugal transfer protein TrbF  46.61 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.736535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0168  conjugal transfer protein TrbF  46.19 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577326  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2345  Conjugal transfer protein  43.26 
 
 		 232 aa  168  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5369  conjugal transfer protein TrbF  37.67 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682768  normal  0.410714 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5216  conjugal transfer protein TrbF  36.32 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2353  Conjugal transfer protein  38.25 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.744768  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1713  Conjugal transfer protein  35.05 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000549304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9260  conjugal transfer protein TrbF  33.03 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399754  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5383  conjugal transfer protein TrbF  32.72 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8326  conjugal transfer protein TrbF  32.88 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.029334  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5489  conjugal transfer protein TrbF  32.73 
 
 		 220 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4562  conjugal transfer protein TrbF  32.13 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9651  conjugal transfer protein TrbF  31.28 
 
 		 221 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2509  conjugal transfer protein  31.05 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal  0.64897 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6506  conjugal transfer protein TrbF  30.77 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4270  conjugal transfer protein TrbF  30.32 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117817  normal  0.0324718 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6631  conjugal transfer protein TrbF  30.32 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1694  conjugal transfer protein  26.09 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194664  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1392  conjugal transfer protein  26.09 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1665  Conjugal transfer protein  28.3 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0898  Type IV secretory pathway TrbF protein-like protein  26.53 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0051  conjugal transfer protein TrbF  26.22 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1190  hypothetical protein  27 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0256  conjugal transfer protein  25.6 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4695  conjugal transfer protein TrbF  23.67 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1084  conjugal transfer protein  51.16 
 
 		 56 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>