81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1713 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1713  Conjugal transfer protein  100 
 
 		 232 aa  479  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000549304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2353  Conjugal transfer protein  65.94 
 
 		 230 aa  340  8e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.744768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2345  Conjugal transfer protein  38.74 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35650  conjugal transfer protein TrbF  40.09 
 
 		 234 aa  168  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109489  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1289  conjugal transfer protein TrbF  40.57 
 
 		 234 aa  168  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2011  conjugal transfer protein TrbF  40.57 
 
 		 234 aa  167  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264252  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2577  conjugal transfer protein TrbF  40.09 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.756433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0431  conjugal transfer protein TrbF  39.62 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4201  conjugal transfer protein TrbF  40.09 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.902696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2357  conjugal transfer protein TrbF  40.09 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.109686  normal  0.258524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3548  conjugal transfer protein TrbF  37.27 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1187  conjugal transfer protein TrbF  37.27 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1902  conjugal transfer protein TrbF  39.15 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.617323  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3858  conjugal transfer protein TrbF  36.92 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00683431  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2692  conjugal transfer protein TrbF  37.74 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0792392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1348  conjugal transfer protein TrbF  39.15 
 
 		 234 aa  157  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000109379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0733  conjugal transfer protein TrbF  38.68 
 
 		 234 aa  157  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3699  conjugal transfer protein TrbF  39.15 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3499  conjugal transfer protein TrbF  38.68 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2651  conjugal transfer protein TrbF  38.21 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0552472  normal  0.84636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30870  conjugal transfer protein TrbF  39.15 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177985  unclonable  2.25295e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1323  conjugal transfer protein TrbF  38.68 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2093  conjugal transfer protein TrbF  37.09 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0618543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2904  conjugal transfer protein TrbF  37.74 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.071912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3993  conjugal transfer protein TrbF  36.77 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0169499  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0692  conjugal transfer protein TrbF  35.98 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0602  conjugal transfer protein TrbF  37.05 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1557  conjugal transfer protein TrbF  38.21 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000776204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3219  conjugal transfer protein TrbF  35.05 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00389999  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0149  conjugal transfer protein TrbF  37.09 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1841  conjugal transfer protein TrbF  36.79 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.377716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0960  conjugal transfer protein TrbF  38.21 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1477  conjugal transfer protein TrbF  35.05 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0985827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0502  conjugal transfer protein TrbF  36.57 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0478499  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3698  conjugal transfer protein TrbF  36.32 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3201  conjugal transfer protein TrbF  35.05 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7447  conjugal transfer protein TrbF  36.15 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7748  conjugal transfer protein TrbF  35.98 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520847  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1006  conjugal transfer protein TrbF  34.98 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1487  conjugal transfer protein TrbF  35.56 
 
 		 226 aa  148  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2317  conjugal transfer protein TrbF  35.51 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.643073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1146  conjugal transfer protein TrbF  37.26 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1506  conjugal transfer protein TrbF  34.43 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3834  conjugal transfer protein TrbF  34.27 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2997  conjugal transfer protein TrbF  33.79 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3534  conjugal transfer protein TrbF  35.21 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776312  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2885  conjugal transfer protein TrbF  34.58 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5369  conjugal transfer protein TrbF  35.05 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682768  normal  0.410714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0742  conjugal transfer protein TrbF  34.27 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3371  conjugal transfer protein TrbF  34.91 
 
 		 227 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3093  conjugal transfer protein TrbF  32.86 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0311  conjugal transfer protein TrbF  33.63 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3894  conjugal transfer protein TrbF  32.74 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2607  conjugal transfer protein TrbF  34.43 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2831  conjugal transfer protein TrbF  31.84 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.571124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0168  conjugal transfer protein TrbF  33.63 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577326  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5216  conjugal transfer protein TrbF  36.15 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2479  conjugal transfer protein TrbF  35.38 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.901597  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4562  conjugal transfer protein TrbF  34.25 
 
 		 220 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2274  conjugal transfer protein TrbF  32.86 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.736535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1665  Conjugal transfer protein  33.18 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2033  conjugal transfer protein TrbF  34.27 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9651  conjugal transfer protein TrbF  34.72 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39699  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5383  conjugal transfer protein TrbF  33.79 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5489  conjugal transfer protein TrbF  34.42 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8326  conjugal transfer protein TrbF  33.94 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.029334  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9260  conjugal transfer protein TrbF  33.94 
 
 		 220 aa  111  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399754  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6506  conjugal transfer protein TrbF  29.46 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4270  conjugal transfer protein TrbF  29.05 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117817  normal  0.0324718 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6631  conjugal transfer protein TrbF  29.05 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0051  conjugal transfer protein TrbF  26.79 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2229  conjugal transfer protein TrbF  28.75 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373405  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1694  conjugal transfer protein  29.95 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194664  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1392  conjugal transfer protein  29.95 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4695  conjugal transfer protein TrbF  25.64 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0256  conjugal transfer protein  29.95 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2509  conjugal transfer protein  26.48 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal  0.64897 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0898  Type IV secretory pathway TrbF protein-like protein  20.22 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1190  hypothetical protein  26.92 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2824  Type IV secretory pathway TrbF protein-like protein  20.83 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4254  Type IV secretory pathway component VirB8-like  24.66 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>