24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1190 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1190  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0898  Type IV secretory pathway TrbF protein-like protein  76.07 
 
 		 234 aa  364  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1191  hypothetical protein  91.43 
 
 		 97 aa  125  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5369  conjugal transfer protein TrbF  28.57 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682768  normal  0.410714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2033  conjugal transfer protein TrbF  27 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2353  Conjugal transfer protein  21.74 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.744768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2345  Conjugal transfer protein  23.81 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5383  conjugal transfer protein TrbF  26.21 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4562  conjugal transfer protein TrbF  26.57 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1841  conjugal transfer protein TrbF  23.45 
 
 		 232 aa  52  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.377716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1713  Conjugal transfer protein  26.92 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000549304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1146  conjugal transfer protein TrbF  24.84 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1665  Conjugal transfer protein  22.77 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5489  conjugal transfer protein TrbF  25.12 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2651  conjugal transfer protein TrbF  25.13 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0552472  normal  0.84636 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6506  conjugal transfer protein TrbF  23.98 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8326  conjugal transfer protein TrbF  23.67 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.029334  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6631  conjugal transfer protein TrbF  23.98 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4270  conjugal transfer protein TrbF  23.98 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117817  normal  0.0324718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3499  conjugal transfer protein TrbF  25.13 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5216  conjugal transfer protein TrbF  20.86 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9651  conjugal transfer protein TrbF  23.88 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39699  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2904  conjugal transfer protein TrbF  24.6 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.071912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9260  conjugal transfer protein TrbF  22.54 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>