84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1146 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1146  conjugal transfer protein TrbF  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1289  conjugal transfer protein TrbF  69.66 
 
 		 234 aa  358  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2011  conjugal transfer protein TrbF  68.8 
 
 		 234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0431  conjugal transfer protein TrbF  68.38 
 
 		 234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2577  conjugal transfer protein TrbF  68.8 
 
 		 234 aa  354  5.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.756433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2357  conjugal transfer protein TrbF  68.8 
 
 		 234 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.109686  normal  0.258524 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0733  conjugal transfer protein TrbF  67.52 
 
 		 234 aa  350  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2651  conjugal transfer protein TrbF  67.95 
 
 		 234 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0552472  normal  0.84636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35650  conjugal transfer protein TrbF  67.52 
 
 		 234 aa  349  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109489  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3499  conjugal transfer protein TrbF  67.09 
 
 		 234 aa  349  3e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2904  conjugal transfer protein TrbF  67.52 
 
 		 234 aa  347  8e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.071912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2692  conjugal transfer protein TrbF  67.52 
 
 		 234 aa  347  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0792392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30870  conjugal transfer protein TrbF  66.24 
 
 		 234 aa  342  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177985  unclonable  2.25295e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1902  conjugal transfer protein TrbF  66.24 
 
 		 234 aa  342  4e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.617323  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1557  conjugal transfer protein TrbF  65.38 
 
 		 234 aa  341  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000776204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1348  conjugal transfer protein TrbF  66.24 
 
 		 234 aa  341  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000109379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3699  conjugal transfer protein TrbF  65.81 
 
 		 234 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1323  conjugal transfer protein TrbF  65.81 
 
 		 234 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4201  conjugal transfer protein TrbF  64.1 
 
 		 234 aa  334  5.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.902696 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3993  conjugal transfer protein TrbF  58.22 
 
 		 229 aa  291  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0169499  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1506  conjugal transfer protein TrbF  57.78 
 
 		 227 aa  287  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3219  conjugal transfer protein TrbF  56.89 
 
 		 229 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00389999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0602  conjugal transfer protein TrbF  57.33 
 
 		 229 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3858  conjugal transfer protein TrbF  55.56 
 
 		 229 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00683431  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1477  conjugal transfer protein TrbF  56.89 
 
 		 229 aa  281  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0985827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3371  conjugal transfer protein TrbF  57.33 
 
 		 227 aa  281  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2093  conjugal transfer protein TrbF  57.33 
 
 		 228 aa  280  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0618543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0692  conjugal transfer protein TrbF  56 
 
 		 229 aa  279  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3548  conjugal transfer protein TrbF  54.22 
 
 		 229 aa  278  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1187  conjugal transfer protein TrbF  54.22 
 
 		 229 aa  278  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3834  conjugal transfer protein TrbF  54.22 
 
 		 227 aa  278  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2317  conjugal transfer protein TrbF  58.04 
 
 		 229 aa  277  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.643073  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1841  conjugal transfer protein TrbF  56.19 
 
 		 232 aa  273  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.377716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0149  conjugal transfer protein TrbF  56.44 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2997  conjugal transfer protein TrbF  52.89 
 
 		 227 aa  272  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0502  conjugal transfer protein TrbF  55.56 
 
 		 229 aa  271  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0478499  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3093  conjugal transfer protein TrbF  52.89 
 
 		 227 aa  270  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3894  conjugal transfer protein TrbF  53.33 
 
 		 226 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7748  conjugal transfer protein TrbF  57.33 
 
 		 226 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520847  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3534  conjugal transfer protein TrbF  54.22 
 
 		 227 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776312  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3201  conjugal transfer protein TrbF  55.56 
 
 		 229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7447  conjugal transfer protein TrbF  52.44 
 
 		 226 aa  268  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3698  conjugal transfer protein TrbF  54.22 
 
 		 227 aa  267  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2885  conjugal transfer protein TrbF  56 
 
 		 227 aa  266  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1006  conjugal transfer protein TrbF  53.78 
 
 		 226 aa  266  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0311  conjugal transfer protein TrbF  55.11 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2607  conjugal transfer protein TrbF  52.44 
 
 		 227 aa  265  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0960  conjugal transfer protein TrbF  54.67 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0742  conjugal transfer protein TrbF  55.11 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2831  conjugal transfer protein TrbF  52.44 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.571124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1487  conjugal transfer protein TrbF  53.78 
 
 		 226 aa  262  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2479  conjugal transfer protein TrbF  52.89 
 
 		 227 aa  242  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.901597  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2033  conjugal transfer protein TrbF  52.44 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0168  conjugal transfer protein TrbF  48.44 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577326  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2274  conjugal transfer protein TrbF  43.05 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.736535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5369  conjugal transfer protein TrbF  41.96 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682768  normal  0.410714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2345  Conjugal transfer protein  44.25 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5216  conjugal transfer protein TrbF  44.2 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2353  Conjugal transfer protein  39.53 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.744768  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1713  Conjugal transfer protein  37.74 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000549304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5489  conjugal transfer protein TrbF  31.8 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9260  conjugal transfer protein TrbF  32.58 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399754  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4562  conjugal transfer protein TrbF  31.02 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8326  conjugal transfer protein TrbF  30.77 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.029334  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5383  conjugal transfer protein TrbF  29.63 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9651  conjugal transfer protein TrbF  30.99 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39699  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6506  conjugal transfer protein TrbF  30.45 
 
 		 260 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6631  conjugal transfer protein TrbF  30.45 
 
 		 260 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4270  conjugal transfer protein TrbF  30.45 
 
 		 260 aa  95.9  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117817  normal  0.0324718 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1665  Conjugal transfer protein  29.11 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1392  conjugal transfer protein  28.7 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1694  conjugal transfer protein  28.7 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194664  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2509  conjugal transfer protein  33.02 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal  0.64897 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0256  conjugal transfer protein  28.7 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0051  conjugal transfer protein TrbF  24.32 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4695  conjugal transfer protein TrbF  26.67 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2229  conjugal transfer protein TrbF  23.79 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373405  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1084  conjugal transfer protein  56.52 
 
 		 56 aa  58.5  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2824  Type IV secretory pathway TrbF protein-like protein  23.5 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1190  hypothetical protein  22.99 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4254  Type IV secretory pathway component VirB8-like  24.58 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5235  Type IV secretory pathway component VirB8-like  25.33 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5457  Type IV secretory pathway component VirB8-like  26.15 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0195796 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  27.86 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>