218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0491 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0491  ribosomal protein L35  100 
 
 		 68 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1162  ribosomal protein L35  72.06 
 
 		 68 aa  94  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000825182  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  57.81 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  43.94 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  48.48 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  45.16 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3042  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173164  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  48.39 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  48.39 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  63.64 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  41.94 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1677  ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0163169  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0174  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0233  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.378648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  56 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  56.82 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  61.9 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  47.06 
 
 		 66 aa  48.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  58 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1384  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000768354  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>