More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0766 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  67.69 
 
 
65 aa  90.1  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  64.06 
 
 
65 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  61.54 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  62.5 
 
 
65 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  60.94 
 
 
65 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 
65 aa  82  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  66.13 
 
 
64 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 
65 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  64.06 
 
 
65 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 
64 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  59.38 
 
 
79 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  60.94 
 
 
65 aa  79.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  59.38 
 
 
65 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 
65 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 
65 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
65 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
65 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 
65 aa  77.8  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  56.25 
 
 
66 aa  77  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  61.54 
 
 
64 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  61.54 
 
 
64 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
64 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
64 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
64 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
64 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
64 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
65 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
64 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
64 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
64 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
65 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
65 aa  74.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
64 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  58.73 
 
 
63 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  59.68 
 
 
68 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 
65 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
64 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
64 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
64 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2030  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 
64 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000722543  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
65 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  61.54 
 
 
64 aa  73.9  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 
65 aa  72.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 
65 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 
64 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 
65 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 
65 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
64 aa  72  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  72  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 
65 aa  72  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2261  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
64 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000246297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 
64 aa  71.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  52.31 
 
 
65 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 
64 aa  70.5  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01686  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0100016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1925  ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01675  hypothetical protein  55.38 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0162765  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2010  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.800044 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1838  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1959  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000143205  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1463  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.3269  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1798  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000060614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1915  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414534  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1474  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0002542  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1430  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000901433  normal  0.0165189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2435  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000580293  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1446  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109072  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
64 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
64 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 
64 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1579  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
64 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  53.03 
 
 
64 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0470  ribosomal protein L35  46.15 
 
 
65 aa  67  0.00000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.835953  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1758  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
64 aa  67  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  55.74 
 
 
63 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>