More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2228 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  131  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  87.5 
 
 
65 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  78.12 
 
 
65 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  75 
 
 
65 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 
65 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  70.31 
 
 
65 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  70.31 
 
 
65 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  68.75 
 
 
65 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  67.69 
 
 
65 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 
64 aa  84.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  67.19 
 
 
65 aa  84  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  67.19 
 
 
64 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  62.9 
 
 
66 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
66 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
66 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
66 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
66 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
66 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
66 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
66 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
66 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
66 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
66 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
66 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
66 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
66 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  62.5 
 
 
64 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  52.31 
 
 
66 aa  73.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  58.46 
 
 
65 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  56.25 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
65 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  56.25 
 
 
79 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  60.32 
 
 
63 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  54.69 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  56.45 
 
 
64 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  57.63 
 
 
66 aa  67.8  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  59.32 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  49.23 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  53.12 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1382  ribosomal protein L35  60.94 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  56.45 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  58.62 
 
 
65 aa  62.8  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1088  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000177578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  49.21 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
68 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  52.31 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  51.56 
 
 
66 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.5  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  51.56 
 
 
64 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  55.36 
 
 
57 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0940  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000354984  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1925  ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3042  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173164  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1430  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000901433  normal  0.0165189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2435  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000580293  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1463  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.3269  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>