More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0365 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  100 
 
 		 65 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  66.15 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  68.75 
 
 		 65 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  63.08 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  63.08 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 64 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  79.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 65 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  73.21 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  59.38 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 65 aa  76.6  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 65 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 94 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  65.52 
 
 		 66 aa  72  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  57.81 
 
 		 64 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  62.69 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  62.69 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  67.86 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  61.9 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 66 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 66 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  54.69 
 
 		 66 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4254  50S ribosomal protein L35  61.19 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 63 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  60.32 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  61.54 
 
 		 57 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  67  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>