134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0233 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0233  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.378648  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0476  ribosomal protein L35  76.56 
 
 		 64 aa  92.8  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  51.56 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  48.39 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  41.94 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  54.55 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  40.32 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  38.71 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0068  50S ribosomal protein L35  48 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.5109  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  53.33 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0174  50S ribosomal protein L35  39.68 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0222  50S ribosomal protein L35  38.18 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0000299958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  37.1 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  46 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  38.1 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  38.1 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  38.1 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  38.71 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  48.89 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1883  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  44 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  42 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1384  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000768354  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  44 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  44 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2502  ribosomal protein L35  41.38 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>