More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2001 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  100 
 
 
65 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  61.9 
 
 
65 aa  74.3  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  60.32 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  61.9 
 
 
65 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  58.06 
 
 
64 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  63.49 
 
 
65 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  63.49 
 
 
65 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  55.56 
 
 
65 aa  72.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  60.32 
 
 
65 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  61.9 
 
 
65 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  61.9 
 
 
65 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  61.9 
 
 
65 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  58.73 
 
 
73 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  60.32 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 
64 aa  70.5  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  57.14 
 
 
65 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  53.97 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  55.56 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
67 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0189  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  55.56 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  53.23 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  55.56 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  55.56 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  52.38 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  54.84 
 
 
64 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  50.79 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  53.23 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  52.38 
 
 
65 aa  62.8  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01686  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0100016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1925  ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2030  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 
64 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000722543  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1915  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414534  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1474  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0002542  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1838  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1959  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000143205  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1446  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109072  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2010  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.800044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1430  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000901433  normal  0.0165189 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2435  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000580293  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1798  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000060614  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1777  50S ribosomal protein L35  56.67 
 
 
62 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.786581 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1463  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.3269  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>