186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1883 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1883  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  124  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1876  50S ribosomal protein L35  98.44 
 
 		 64 aa  121  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.322523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  67.19 
 
 		 64 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  68.75 
 
 		 64 aa  84.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  65.08 
 
 		 64 aa  83.6  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 		 64 aa  80.5  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  65.62 
 
 		 64 aa  80.1  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  63.49 
 
 		 64 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 64 aa  76.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  57.81 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  60.32 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12260  LSU ribosomal protein L35P  56.25 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162562  normal  0.135462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  52.38 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  47.62 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  48.39 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  47.62 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0174  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  51.85 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0476  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2171  ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000338785  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0121  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.379431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2384  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176561  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 403 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1162  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000825182  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  41.94 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  37.1 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2261  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000246297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2907  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471347  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  49.21 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  52.27 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4254  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  37.1 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  43.55 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>