231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3181 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  71.88 
 
 		 64 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  68.75 
 
 		 64 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  71.43 
 
 		 64 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 		 64 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 64 aa  86.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  61.9 
 
 		 64 aa  84.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 64 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 64 aa  84.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  67.74 
 
 		 64 aa  84  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  67.19 
 
 		 64 aa  83.6  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  59.38 
 
 		 64 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  61.9 
 
 		 64 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 64 aa  82  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  61.9 
 
 		 64 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 64 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 64 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 		 64 aa  77  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  58.73 
 
 		 63 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  57.81 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12260  LSU ribosomal protein L35P  54.69 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162562  normal  0.135462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1883  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1876  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.322523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  64.81 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  45.16 
 
 		 79 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  49.21 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0174  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2384  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176561  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  53.23 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  50.88 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0121  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.379431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  47.62 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  43.55 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0476  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  41.27 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  43.1 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1033  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.753254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  41.38 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  39.68 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  41.67 
 
 		 403 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  40.32 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0679  50S ribosomal protein L35  35.48 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000758197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>