More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0561 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  124  5e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  66.13 
 
 
65 aa  81.6  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  65.62 
 
 
64 aa  80.1  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 
65 aa  77.4  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  58.73 
 
 
64 aa  73.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 
64 aa  73.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  54.69 
 
 
66 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  56.45 
 
 
66 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
64 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  59.38 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  51.56 
 
 
66 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0994  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  56.25 
 
 
64 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
64 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
64 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
64 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00825  ribosomal protein L35  60.94 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  53.97 
 
 
71 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  53.23 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  53.23 
 
 
63 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
65 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  51.61 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  51.61 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  55.56 
 
 
64 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  45.31 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  60.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  50 
 
 
73 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1579  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
64 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  60.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
66 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  48.39 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  57.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  48.39 
 
 
63 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
64 aa  57.4  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
67 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  45.16 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>