227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3038 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  68.25 
 
 		 64 aa  90.9  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  69.84 
 
 		 64 aa  90.5  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  68.25 
 
 		 64 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  69.84 
 
 		 64 aa  89.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  71.43 
 
 		 64 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  68.25 
 
 		 64 aa  89.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  58.73 
 
 		 64 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 64 aa  80.9  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 64 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  60.32 
 
 		 64 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  53.97 
 
 		 63 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 64 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12260  LSU ribosomal protein L35P  58.73 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162562  normal  0.135462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 71 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0476  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1883  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2384  ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176561  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1876  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.322523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  48.44 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  53.7 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0174  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  41.94 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1162  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000825182  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1088  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000177578  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  43.55 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  43.55 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  39.68 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2171  ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000338785  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  45.31 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  41.94 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>