192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2384 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2384  ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176561  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12260  LSU ribosomal protein L35P  70.31 
 
 		 64 aa  90.5  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162562  normal  0.135462 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  67.19 
 
 		 64 aa  82  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  64.06 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  55.56 
 
 		 63 aa  71.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  56.25 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  49.21 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  47.62 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1883  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1254  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00450085  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1876  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.322523 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1202  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  53.7 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0476  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0924  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000127679  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  45.16 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  46.77 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1677  ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0163169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  44.26 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  50.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0994  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  41.27 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  38.1 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0767  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  41.67 
 
 		 403 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0679  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000758197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>