282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1312 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  53.85 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  54.69 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  46.88 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  44.62 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  46.88 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  48.39 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2922  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  42.19 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  42.19 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  52  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  58.33 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  58.33 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  50.8  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  39.68 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  47.76 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  47.76 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  39.68 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>