More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1413 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  128  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  98.44 
 
 		 64 aa  127  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  67.74 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  66.13 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  72  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  60.32 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  58.73 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  61.29 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  53.23 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  51.61 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  53.33 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0346  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  56.67 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  53.7 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  48.39 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2261  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000246297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1430  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000901433  normal  0.0165189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>