More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0045 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  128  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  68.75 
 
 
65 aa  90.1  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  62.5 
 
 
65 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  59.38 
 
 
65 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
65 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 
65 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 
65 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  62.5 
 
 
65 aa  80.5  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 
65 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
64 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 
65 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  59.38 
 
 
65 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  77.4  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  58.46 
 
 
68 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  64.06 
 
 
64 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  53.12 
 
 
65 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
65 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  54.69 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  57.81 
 
 
66 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 
65 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  57.81 
 
 
65 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  54.69 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  57.81 
 
 
66 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  56.25 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  72.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 
65 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  56.25 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  56.25 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  63.79 
 
 
64 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  50.77 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
64 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  55.56 
 
 
65 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  58.33 
 
 
65 aa  70.1  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  55.56 
 
 
63 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  58.06 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
64 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
64 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
64 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  55.38 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
64 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 
63 aa  67  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  53.85 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3042  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173164  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  55 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  51.61 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0940  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000354984  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>