283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1998 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  93.85 
 
 		 65 aa  121  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  84.62 
 
 		 65 aa  108  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  72.41 
 
 		 63 aa  83.6  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 64 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2595  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 64 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519025  hitchhiker  0.00116473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  69.49 
 
 		 64 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  69.49 
 
 		 64 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  69.49 
 
 		 64 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  71.93 
 
 		 64 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  71.93 
 
 		 64 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  69.49 
 
 		 64 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  69.49 
 
 		 64 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  69.49 
 
 		 64 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  67.8 
 
 		 64 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  69.49 
 
 		 64 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1579  50S ribosomal protein L35  64.41 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  66.1 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  65.08 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  67.21 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  67.21 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  67.21 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 64 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  67.21 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2030  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 64 aa  72  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000722543  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  61.29 
 
 		 65 aa  72  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 64 aa  72  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 64 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 64 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 64 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2261  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000246297  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  60.32 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  58.73 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  60.66 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  59.32 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0940  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000354984  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1758  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0346  50S ribosomal protein L35  57.63 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  56.45 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  58.06 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  60.34 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  58.33 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  57.38 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  56.67 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0083  ribosomal protein L35  56.9 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000192427  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>