More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2306 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  73.44 
 
 		 65 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  71.88 
 
 		 65 aa  97.1  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  68.75 
 
 		 65 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  70.31 
 
 		 65 aa  93.6  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  67.69 
 
 		 65 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  67.69 
 
 		 65 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  53.85 
 
 		 66 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  54.69 
 
 		 79 aa  72  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  57.81 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 66 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 63 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1240  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000491229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  52.31 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  48.44 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1279  50S ribosomal protein L35P  53.23 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.686056  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  55 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 67 aa  67  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 67 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  50 
 
 		 68 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>