More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2852 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 67 aa  133  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  94.03 
 
 		 67 aa  126  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  92.54 
 
 		 73 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  89.55 
 
 		 67 aa  121  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  89.55 
 
 		 67 aa  120  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  89.55 
 
 		 67 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  88.06 
 
 		 67 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  86.57 
 
 		 67 aa  116  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  83.58 
 
 		 67 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  82.09 
 
 		 67 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  82.09 
 
 		 67 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  77.78 
 
 		 65 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  76.19 
 
 		 65 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 81 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  94  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  73.02 
 
 		 65 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  73.02 
 
 		 65 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  71.43 
 
 		 65 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  69.84 
 
 		 65 aa  90.9  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1777  50S ribosomal protein L35  73.33 
 
 		 62 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.786581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  69.84 
 
 		 65 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  69.84 
 
 		 65 aa  88.6  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  68.25 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  63.49 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0831  50S ribosomal protein L35  71.43 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.227484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  55.56 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  50.79 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  49.21 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0940  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000354984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  53.97 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  49.25 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  50.79 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  48.39 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1758  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  50 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  49.21 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2261  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000246297  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2030  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000722543  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>