276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3091 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  100 
 
 		 67 aa  134  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  92.54 
 
 		 67 aa  123  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  91.04 
 
 		 67 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  91.04 
 
 		 67 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  88.06 
 
 		 67 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  88.06 
 
 		 67 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  88.06 
 
 		 67 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  86.57 
 
 		 67 aa  117  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  86.57 
 
 		 67 aa  117  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  83.58 
 
 		 73 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  86.57 
 
 		 67 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 81 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 65 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  72.31 
 
 		 65 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  70.77 
 
 		 65 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1777  50S ribosomal protein L35  74.19 
 
 		 62 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.786581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  70.77 
 
 		 65 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  69.23 
 
 		 65 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  67.69 
 
 		 65 aa  87.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  64.62 
 
 		 65 aa  80.9  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0831  50S ribosomal protein L35  70.77 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.227484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  56.92 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  55.56 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  46.03 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  46.03 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0940  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2261  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000246297  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  49.23 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2030  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000722543  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  46.03 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  45.16 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1758  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>