262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf193 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
62 aa  123  1e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  59.68 
 
 
66 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 
66 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0204  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
63 aa  61.6  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
68 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  55.56 
 
 
65 aa  60.1  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
73 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  51.85 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  53.23 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl189  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  57.8  0.00000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172022  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  48.39 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  45.16 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  54.39 
 
 
57 aa  54.7  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  44.44 
 
 
65 aa  54.7  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 
64 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0223  50S ribosomal protein L35  51.72 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.0000237579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 
64 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2171  ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000338785  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1240  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000491229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  46.77 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  45.16 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  58.33 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  49.15 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  49.18 
 
 
67 aa  52  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2922  50S ribosomal protein L35  49.18 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  52.54 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 
65 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  52.54 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  49.12 
 
 
66 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  45.16 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  43.55 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  41.94 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  35.48 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 
67 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 
65 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1279  50S ribosomal protein L35P  43.55 
 
 
65 aa  50.4  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.686056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  43.55 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_657  ribosomal protein L35  41.94 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000644452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  43.55 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  41.94 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1088  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000177578  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>