More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05730 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  100 
 
 		 65 aa  131  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  87.69 
 
 		 65 aa  116  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  69.23 
 
 		 65 aa  91.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  65.08 
 
 		 66 aa  84  7e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  66.67 
 
 		 65 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  67.86 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  56.9 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  61.9 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  56.67 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  56.9 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  55 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  48.39 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  53.23 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  58.62 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  53.33 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  58.62 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  56.9 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  50.79 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  52.38 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  55.36 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  56.67 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  50 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  49.25 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 64 aa  60.1  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  49.23 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12260  LSU ribosomal protein L35P  50.79 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162562  normal  0.135462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  58 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  47.76 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  51.72 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  51.72 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  57  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  46.27 
 
 		 73 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  50 
 
 		 403 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  44.44 
 
 		 63 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1162  ribosomal protein L35  50 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000825182  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2384  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176561  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0767  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>