More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1822 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  100 
 
 		 64 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 65 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  71.88 
 
 		 65 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  71.88 
 
 		 65 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 64 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 64 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  64.06 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  78 
 
 		 57 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 65 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  56.25 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 63 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 65 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  63.49 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  57.81 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  72 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  61.9 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  58.73 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  60.32 
 
 		 66 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  60.32 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  57.81 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  60.32 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  67  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 66 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 66 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  60.32 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  63.49 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  63.49 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0121  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.379431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  60.32 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1579  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  55.56 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  53.12 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  68.75 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  65.38 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>