More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0429 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  66.13 
 
 		 65 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  67.74 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  66.13 
 
 		 64 aa  78.2  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  59.68 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  53.33 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  51.67 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  59.26 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  50.79 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0174  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  51.61 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  43.55 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  58.33 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0121  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.379431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  62.5 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  56.9 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  48.39 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>