More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0426 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  131  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 65 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  61.54 
 
 		 65 aa  77.8  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  61.54 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  61.54 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  60 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  60.32 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  53.12 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 64 aa  70.1  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3042  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173164  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  53.12 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  54.69 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  63.46 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  54.69 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  53.33 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  60 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4254  50S ribosomal protein L35  50.75 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>