154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12260 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12260  LSU ribosomal protein L35P  100 
 
 		 64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162562  normal  0.135462 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 64 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  65.62 
 
 		 64 aa  82  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  62.5 
 
 		 64 aa  79.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 64 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2384  ribosomal protein L35  70.31 
 
 		 64 aa  78.2  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176561  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 64 aa  76.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  58.73 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  60.32 
 
 		 64 aa  72  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  57.14 
 
 		 63 aa  71.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1883  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1876  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.322523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  55.56 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  50.79 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  46.03 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  49.21 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  46.77 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  50.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  41.94 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1162  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000825182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1677  ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0163169  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  41.94 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  47.4  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0476  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  41.94 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  39.68 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0710  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000179366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  40.98 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0174  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0994  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  38.1 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0924  50S ribosomal protein L35  40.91 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000127679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>