291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_15190 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  100 
 
 		 65 aa  129  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  72.31 
 
 		 65 aa  94  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  69.23 
 
 		 65 aa  91.7  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  69.84 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  62.07 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  59.32 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  55.93 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  68.75 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  59.26 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  68.89 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  55.93 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  50.79 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  50.85 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  51.72 
 
 		 403 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  56.9 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  52.54 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  57.41 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  49.15 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  50.85 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0679  50S ribosomal protein L35  50.91 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000758197  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  53.7 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  50.79 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  53.7 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  53.7 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0128  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0134182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  50.85 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  46.03 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12260  LSU ribosomal protein L35P  49.21 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162562  normal  0.135462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  51.85 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2384  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176561  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  62.22 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0767  ribosomal protein L35  48.21 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  53.7 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1677  ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0163169  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  50.91 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1162  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000825182  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  58 
 
 		 57 aa  52.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1254  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00450085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 67 aa  52  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1202  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750634  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_657  ribosomal protein L35  50.91 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000644452  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 64 aa  52  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  52  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  51.72 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  51.72 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  53.57 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>