214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0450 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
66 aa  134  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  81.82 
 
 
66 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  80.3 
 
 
66 aa  110  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  73.44 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3484  50S ribosomal protein L35  75 
 
 
67 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372856  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  73.02 
 
 
66 aa  96.3  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  71.88 
 
 
67 aa  95.9  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4268  50S ribosomal protein L35  71.88 
 
 
67 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  71.43 
 
 
66 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  73.02 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4533  50S ribosomal protein L35  71.88 
 
 
67 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  71.21 
 
 
66 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  71.21 
 
 
66 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  71.21 
 
 
66 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  69.7 
 
 
66 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  68.75 
 
 
67 aa  92.8  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  65.67 
 
 
67 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  65.67 
 
 
67 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  65.67 
 
 
67 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 
66 aa  83.6  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0128  50S ribosomal protein L35P  66.67 
 
 
66 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0134182  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  66.13 
 
 
67 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  57.58 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  57.58 
 
 
66 aa  80.5  0.000000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  56.92 
 
 
66 aa  80.1  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 
66 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 
66 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0864  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
68 aa  79  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2922  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
67 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
66 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 
66 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 
66 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  64.06 
 
 
403 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 
66 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
67 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 
66 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0068  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
66 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.5109  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  70.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  53.85 
 
 
68 aa  71.2  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
67 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
67 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  51.61 
 
 
65 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  50.79 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  46.88 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  51.72 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  43.55 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 
64 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  46.55 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
66 aa  53.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
67 aa  50.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  45.16 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 
64 aa  50.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1881  50S ribosomal protein L35  44.78 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0627786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  41.94 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1974  50S ribosomal protein L35  44.78 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1989  50S ribosomal protein L35  44.78 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0980049  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1904  50S ribosomal protein L35  44.78 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  40.32 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0679  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000758197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>